論文の概要: Building a Corpus for Biomedical Relation Extraction of Species Mentions
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.08403v1
- Date: Wed, 14 Jun 2023 09:56:32 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-16 19:29:17.239363
- Title: Building a Corpus for Biomedical Relation Extraction of Species Mentions
- Title(参考訳): 生物医学的関連抽出のためのコーパスの構築
- Authors: Oumaima El Khettari, Solen Quiniou, Samuel Chaffron
- Abstract要約: バイオメディカルテキスト中の種間の有意義な二分関係を抽出するために,手動で注釈付きコーパス,種-種間相互作用を提案する。
最初の成果は、BERTとその生物医学的変異体を用いた種間関係の抽出である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.48986598953553556
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We present a manually annotated corpus, Species-Species Interaction, for
extracting meaningful binary relations between species, in biomedical texts, at
sentence level, with a focus on the gut microbiota. The corpus leverages
PubTator to annotate species in full-text articles after evaluating different
Named Entity Recognition species taggers. Our first results are promising for
extracting relations between species using BERT and its biomedical variants.
- Abstract(参考訳): バイオメディカルテキストの文レベルで,生物間の有意義な連接関係を抽出するために,手動で注釈付きコーパス,種-種間相互作用(種-種間相互作用)を提案する。
このコーパスはpubtatorを利用して、異なる名前付きエンティティ認識種タガーを評価した後、全文記事に種を注釈付けする。
最初の成果は、BERTとその生物医学的変異体を用いた種間関係の抽出である。
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