論文の概要: Bootstrap aggregation and confidence measures to improve time series
causal discovery
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.08946v1
- Date: Thu, 15 Jun 2023 08:37:16 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-16 15:56:01.915024
- Title: Bootstrap aggregation and confidence measures to improve time series
causal discovery
- Title(参考訳): 時系列因果発見を改善するブートストラップ収集と信頼度対策
- Authors: Kevin Debeire (1 and 2), Jakob Runge (2 and 3), Andreas Gerhardus (2)
and Veronika Eyring (1 and 4) ((1) DLR, Institut f\"ur Physik der
Atmosph\"are, Oberpfaffenhofen, Germany, (2) DLR, Institut f\"ur
Datenwissenschaften, Jena, Germany, (3) Technische Universit\"at Berlin,
Faculty of Computer Science, Berlin, Germany, (4) University of Bremen,
Institute of Environmental Physics, Bremen, Germany)
- Abstract要約: 本稿では,時系列因果発見と組み合わせた新しいブートストラップアグリゲーション(バッグ)と信頼度測定手法を提案する。
本手法では,因果探索法により計算された時系列グラフのリンクに対する信頼度を測定することができる。
本研究では,現状の条件付き独立性に基づくアルゴリズムPCMCI+を併用する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Causal discovery methods have demonstrated the ability to identify the time
series graphs representing the causal temporal dependency structure of
dynamical systems. However, they do not include a measure of the confidence of
the estimated links. Here, we introduce a novel bootstrap aggregation (bagging)
and confidence measure method that is combined with time series causal
discovery. This new method allows measuring confidence for the links of the
time series graphs calculated by causal discovery methods. This is done by
bootstrapping the original times series data set while preserving temporal
dependencies. Next to confidence measures, aggregating the bootstrapped graphs
by majority voting yields a final aggregated output graph. In this work, we
combine our approach with the state-of-the-art conditional-independence-based
algorithm PCMCI+. With extensive numerical experiments we empirically
demonstrate that, in addition to providing confidence measures for links,
Bagged-PCMCI+ improves the precision and recall of its base algorithm PCMCI+.
Specifically, Bagged-PCMCI+ has a higher detection power regarding adjacencies
and a higher precision in orienting contemporaneous edges while at the same
time showing a lower rate of false positives. These performance improvements
are especially pronounced in the more challenging settings (short time sample
size, large number of variables, high autocorrelation). Our bootstrap approach
can also be combined with other time series causal discovery algorithms and can
be of considerable use in many real-world applications, especially when
confidence measures for the links are desired.
- Abstract(参考訳): 因果探索法は動的システムの因果的時間依存性構造を表す時系列グラフを識別する能力を示した。
しかし、それらは推定されたリンクの信頼性の尺度を含まない。
本稿では,新しいブートストラップアグリゲーション(バッキング)と信頼度測定法を紹介し,時系列因果関係の発見と組み合わせる。
本手法は,因果探索法により計算された時系列グラフのリンクに対する信頼度を測定する。
これは、時間依存を維持しながら元の時系列データセットをブートストラップすることで行われる。
信頼度測定の次に、多数決による自己進行グラフを集約すると、最終的な集計出力グラフが得られる。
そこで本研究では,本手法を条件依存型pcmci+アルゴリズムと組み合わせる。
大規模な数値実験により、Bagged-PCMCI+はリンクに対する信頼度の測定に加えて、ベースアルゴリズムPCMCI+の精度とリコールを改善することが実証された。
具体的には、Bagged-PCMCI+は、隣接性に関する高い検出力と、同時に偽陽性率の低下を示すと同時に、同時エッジの方位検出精度が高い。
これらのパフォーマンス改善は特に、より困難な設定(短い時間サンプルサイズ、多数の変数、高い自己相関)で顕著である。
我々のブートストラップアプローチは他の時系列因果探索アルゴリズムと組み合わせることができ、特にリンクに対する信頼度測定が望まれている場合、多くの実世界のアプリケーションでかなり有効である。
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