論文の概要: Can a single image processing algorithm work equally well across all
phases of DCE-MRI?
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.12988v1
- Date: Thu, 22 Jun 2023 15:44:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-23 13:59:47.922994
- Title: Can a single image processing algorithm work equally well across all
phases of DCE-MRI?
- Title(参考訳): 単一の画像処理アルゴリズムはDCE-MRIのすべてのフェーズで等しく機能するのか?
- Authors: Adam G. Tattersall, Keith A. Goatman, Lucy E. Kershaw, Scott I. K.
Semple and Sonia Dahdouh
- Abstract要約: 本稿では,2つのタスクに対するコントラスト強化(CE)データの比率の異なるトレーニングの効果について検討する。
その結果,CEデータによる事前学習と非CEデータによる微調整により,一般化可能なモデルが得られた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Image segmentation and registration are said to be challenging when applied
to dynamic contrast enhanced MRI sequences (DCE-MRI). The contrast agent causes
rapid changes in intensity in the region of interest and elsewhere, which can
lead to false positive predictions for segmentation tasks and confound the
image registration similarity metric. While it is widely assumed that contrast
changes increase the difficulty of these tasks, to our knowledge no work has
quantified these effects. In this paper we examine the effect of training with
different ratios of contrast enhanced (CE) data on two popular tasks:
segmentation with nnU-Net and Mask R-CNN and registration using VoxelMorph and
VTN. We experimented further by strategically using the available datasets
through pretraining and fine tuning with different splits of data. We found
that to create a generalisable model, pretraining with CE data and fine tuning
with non-CE data gave the best result. This interesting find could be expanded
to other deep learning based image processing tasks with DCE-MRI and provide
significant improvements to the models performance.
- Abstract(参考訳): ダイナミックコントラスト強調MRI(DCE-MRI)に適用した場合,画像分割と登録は困難であると言われている。
コントラスト剤は関心領域などの強度の急激な変化を引き起こすため、セグメンテーションタスクの誤った正の予測や、画像登録類似度指標の相違につながる可能性がある。
コントラストの変化はこれらのタスクの難易度を高めると広く考えられているが、我々の知識ではこれらの効果を定量化していない。
本稿では,nU-NetとMask R-CNNのセグメンテーションとVoxelMorphとVTNを用いた登録という2つの一般的なタスクに対するコントラスト強化(CE)データの異なる比率でのトレーニングの効果を検討する。
我々は,データ分割の異なる事前トレーニングと微調整を通じて,利用可能なデータセットを戦略的に利用してさらに実験を行った。
その結果,CEデータによる事前学習と非CEデータによる微調整により,一般化可能なモデルが得られた。
この興味深い発見は、DCE-MRIによる他のディープラーニングベースの画像処理タスクに拡張され、モデルのパフォーマンスが大幅に改善される可能性がある。
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