論文の概要: Learning normal asymmetry representations for homologous brain
structures
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2306.15811v1
- Date: Tue, 27 Jun 2023 22:03:34 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-06-29 16:25:00.872061
- Title: Learning normal asymmetry representations for homologous brain
structures
- Title(参考訳): 相同性脳構造の正規非対称性表現の学習
- Authors: Duilio Deangeli, Emmanuel Iarussi, Juan Pablo Princich, Mariana
Bendersky, Ignacio Larrabide, Jos\'e Ignacio Orlando
- Abstract要約: 本稿では,異常検出と表現学習に基づいて,脳構造における正常な非対称性パターンを学習する新しい手法を提案する。
本フレームワークは,脳構造物の左右半球側の3次元セグメンテーションを,支持ベクトルデータ記述目的を用いて学習した通常の非対称性埋め込み空間にマッピングするために,シームズアーキテクチャを用いている。
健康なサンプルのみを用いてトレーニングすることで、学習された通常の空間の中心への埋め込み距離を測定することで、目に見えないサンプルにおける通常の非対称性パターンからの偏差を定量化することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.4574055809542305
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Although normal homologous brain structures are approximately symmetrical by
definition, they also have shape differences due to e.g. natural ageing. On the
other hand, neurodegenerative conditions induce their own changes in this
asymmetry, making them more pronounced or altering their location. Identifying
when these alterations are due to a pathological deterioration is still
challenging. Current clinical tools rely either on subjective evaluations,
basic volume measurements or disease-specific deep learning models. This paper
introduces a novel method to learn normal asymmetry patterns in homologous
brain structures based on anomaly detection and representation learning. Our
framework uses a Siamese architecture to map 3D segmentations of left and right
hemispherical sides of a brain structure to a normal asymmetry embedding space,
learned using a support vector data description objective. Being trained using
healthy samples only, it can quantify deviations-from-normal-asymmetry patterns
in unseen samples by measuring the distance of their embeddings to the center
of the learned normal space. We demonstrate in public and in-house sets that
our method can accurately characterize normal asymmetries and detect
pathological alterations due to Alzheimer's disease and hippocampal sclerosis,
even though no diseased cases were accessed for training. Our source code is
available at https://github.com/duiliod/DeepNORHA.
- Abstract(参考訳): 正常な相同性脳構造は定義上ほぼ対称であるが、例えば自然老化による形状の違いもある。
一方、神経変性条件は、この非対称性に独自の変化を誘発し、より発音され、あるいは位置を変化させる。
病的悪化による変化の特定は依然として困難である。
現在の臨床ツールは主観的評価、基本音量測定、疾患特異的ディープラーニングモデルのいずれかに依存している。
本稿では,異常検出と表現学習に基づく相同脳構造の正規非対称性パターンを学習する新しい手法を提案する。
本フレームワークは,脳構造物の左右半球側の3次元セグメンテーションを,支持ベクトルデータ記述目的を用いて学習した通常の非対称性埋め込み空間にマッピングするために,シームズアーキテクチャを用いている。
健全なサンプルのみを使用してトレーニングすることで、埋め込みから学習された正規空間の中心までの距離を計測することで、見当たらないサンプルにおける正規非対称性パターンからの偏差を定量化することができる。
本手法は, アルツハイマー病や海馬硬化症による病態変化を正確に把握し, 正常な非対称性を正確に評価できることを, 公立および社内で実証した。
ソースコードはhttps://github.com/duiliod/deepnorha.comから入手できます。
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