論文の概要: Multimodal brain age estimation using interpretable adaptive
population-graph learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.04639v1
- Date: Mon, 10 Jul 2023 15:35:31 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-07-11 12:30:48.634457
- Title: Multimodal brain age estimation using interpretable adaptive
population-graph learning
- Title(参考訳): 適応型集団グラフ学習を用いたマルチモーダル脳年齢推定
- Authors: Kyriaki-Margarita Bintsi, Vasileios Baltatzis, Rolandos Alexandros
Potamias, Alexander Hammers, Daniel Rueckert
- Abstract要約: 下流タスクに最適化された人口グラフ構造を学習するフレームワークを提案する。
注意機構は、画像と非画像の特徴のセットに重みを割り当てる。
グラフ構築において最も重要な注意重みを可視化することにより、グラフの解釈可能性を高める。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 58.99653132076496
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Brain age estimation is clinically important as it can provide valuable
information in the context of neurodegenerative diseases such as Alzheimer's.
Population graphs, which include multimodal imaging information of the subjects
along with the relationships among the population, have been used in literature
along with Graph Convolutional Networks (GCNs) and have proved beneficial for a
variety of medical imaging tasks. A population graph is usually static and
constructed manually using non-imaging information. However, graph construction
is not a trivial task and might significantly affect the performance of the
GCN, which is inherently very sensitive to the graph structure. In this work,
we propose a framework that learns a population graph structure optimized for
the downstream task. An attention mechanism assigns weights to a set of imaging
and non-imaging features (phenotypes), which are then used for edge extraction.
The resulting graph is used to train the GCN. The entire pipeline can be
trained end-to-end. Additionally, by visualizing the attention weights that
were the most important for the graph construction, we increase the
interpretability of the graph. We use the UK Biobank, which provides a large
variety of neuroimaging and non-imaging phenotypes, to evaluate our method on
brain age regression and classification. The proposed method outperforms
competing static graph approaches and other state-of-the-art adaptive methods.
We further show that the assigned attention scores indicate that there are both
imaging and non-imaging phenotypes that are informative for brain age
estimation and are in agreement with the relevant literature.
- Abstract(参考訳): アルツハイマー病などの神経変性疾患の文脈において貴重な情報を提供できるため、脳年齢の推定は臨床的に重要である。
人口グラフは、被検体のマルチモーダルイメージング情報と人口間の関係を含むが、グラフ畳み込みネットワーク(GCN)と共に文献に使われ、様々な医療画像タスクに有用であることが証明されている。
人口グラフは通常静的であり、非画像情報を用いて手動で構築される。
しかし、グラフの構成は自明な作業ではなく、本質的にグラフ構造に非常に敏感なGCNの性能に大きな影響を与える可能性がある。
本研究では,下流タスクに最適化された人口グラフ構造を学習するフレームワークを提案する。
注意機構は、重みを一連の撮像特徴と非撮像特徴(表現型)に割り当て、エッジ抽出に使用する。
結果のグラフはGCNのトレーニングに使用される。
パイプライン全体はエンドツーエンドでトレーニングすることができる。
さらに、グラフ構築において最も重要な注意重みを可視化することにより、グラフの解釈可能性を高める。
我々は,多種多様な神経画像および非画像表現型を提供する英国バイオバンクを用いて,脳年齢の回帰と分類の手法を評価する。
提案手法は, 競合する静的グラフアプローチや他の最先端適応手法よりも優れている。
さらに、アサインされた注意スコアは、脳年齢推定に有用な画像と非画像表現型の両方が存在し、関連する文献と一致していることを示す。
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