論文の概要: Rethinking Mitosis Detection: Towards Diverse Data and Feature
Representation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.05889v1
- Date: Wed, 12 Jul 2023 03:33:11 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-07-13 14:28:47.116867
- Title: Rethinking Mitosis Detection: Towards Diverse Data and Feature
Representation
- Title(参考訳): 分裂検出の再検討: 多様なデータと特徴表現に向けて
- Authors: Hao Wang, Jiatai Lin, Danyi Li, Jing Wang, Bingchao Zhao, Zhenwei Shi,
Xipeng Pan, Huadeng Wang, Bingbing Li, Changhong Liang, Guoqiang Han, Li
Liang, Chu Han, Zaiyi Liu
- Abstract要約: ミトコンドリア検出のための新しい一般化可能なフレームワーク(MitDet)を提案する。
提案手法は,いくつかの一般的なミトーシス検出データセットにおいて,SOTAのアプローチよりも優れた性能を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 30.882319057927052
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Mitosis detection is one of the fundamental tasks in computational pathology,
which is extremely challenging due to the heterogeneity of mitotic cell. Most
of the current studies solve the heterogeneity in the technical aspect by
increasing the model complexity. However, lacking consideration of the
biological knowledge and the complex model design may lead to the overfitting
problem while limited the generalizability of the detection model. In this
paper, we systematically study the morphological appearances in different
mitotic phases as well as the ambiguous non-mitotic cells and identify that
balancing the data and feature diversity can achieve better generalizability.
Based on this observation, we propose a novel generalizable framework (MitDet)
for mitosis detection. The data diversity is considered by the proposed
diversity-guided sample balancing (DGSB). And the feature diversity is
preserved by inter- and intra- class feature diversity-preserved module
(InCDP). Stain enhancement (SE) module is introduced to enhance the
domain-relevant diversity of both data and features simultaneously. Extensive
experiments have demonstrated that our proposed model outperforms all the SOTA
approaches in several popular mitosis detection datasets in both internal and
external test sets using minimal annotation efforts with point annotations
only. Comprehensive ablation studies have also proven the effectiveness of the
rethinking of data and feature diversity balancing. By analyzing the results
quantitatively and qualitatively, we believe that our proposed model not only
achieves SOTA performance but also might inspire the future studies in new
perspectives. Source code is at https://github.com/Onehour0108/MitDet.
- Abstract(参考訳): 分裂の検出は、計算病理学における基本的な課題の1つであり、分裂細胞の多様性のために非常に困難である。
現在の研究のほとんどは、モデルの複雑さを増大させることで、技術的な側面における不均一性を解決する。
しかし、生物学的知識や複雑なモデル設計の考慮を欠くことは、検出モデルの一般化可能性を制限する一方で、過剰フィッティング問題につながる可能性がある。
本稿では,異なる分裂期および曖昧な非分裂細胞における形態学的外観を体系的に研究し,データと特徴の多様性のバランスがよりよい一般化性を達成することができることを明らかにする。
そこで本研究ではmitdet(generalizable framework for mitosis detection)を提案する。
データ多様性は、提案された多様性誘導サンプルバランス(DGSB)によって考慮される。
特徴多様性はクラス内およびクラス内特徴多様性保存モジュール(InCDP)によって保存される。
Stain enhancement (SE)モジュールは、データと機能のドメイン関連多様性を同時に向上するために導入された。
広範囲な実験により,提案手法は点アノテーションのみを用いた最小限のアノテーションによる内部および外部テストセットにおいて,いくつかの一般的なミトーシス検出データセットにおいて,SOTAアプローチよりも優れた性能を示した。
包括的アブレーション研究は、データの再考と特徴の多様性バランスの効果も証明している。
実験結果を定量的に定性的に分析することにより,提案モデルがSOTAの性能を達成するだけでなく,新たな観点からの今後の研究を促すことができると考えている。
ソースコードはhttps://github.com/onehour0108/mitdet。
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