論文の概要: SwIPE: Efficient and Robust Medical Image Segmentation with Implicit Patch Embeddings
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.12429v2
- Date: Thu, 21 Mar 2024 05:59:17 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-22 20:29:39.881457
- Title: SwIPE: Efficient and Robust Medical Image Segmentation with Implicit Patch Embeddings
- Title(参考訳): SwIPE : 急激なパッチ埋め込みによる効率的かつロバストな医用画像分割
- Authors: Yejia Zhang, Pengfei Gu, Nishchal Sapkota, Danny Z. Chen,
- Abstract要約: 正確な局所境界線とグローバルな形状コヒーレンスを実現するために,SwIPE(Segmentation with Implicit Patch Embeddings)を提案する。
その結果,最近の暗黙的アプローチよりもSwIPEは大幅に改善され,パラメータが10倍以上の最先端の離散手法よりも優れていた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.79344668998054
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Modern medical image segmentation methods primarily use discrete representations in the form of rasterized masks to learn features and generate predictions. Although effective, this paradigm is spatially inflexible, scales poorly to higher-resolution images, and lacks direct understanding of object shapes. To address these limitations, some recent works utilized implicit neural representations (INRs) to learn continuous representations for segmentation. However, these methods often directly adopted components designed for 3D shape reconstruction. More importantly, these formulations were also constrained to either point-based or global contexts, lacking contextual understanding or local fine-grained details, respectively--both critical for accurate segmentation. To remedy this, we propose a novel approach, SwIPE (Segmentation with Implicit Patch Embeddings), that leverages the advantages of INRs and predicts shapes at the patch level--rather than at the point level or image level--to enable both accurate local boundary delineation and global shape coherence. Extensive evaluations on two tasks (2D polyp segmentation and 3D abdominal organ segmentation) show that SwIPE significantly improves over recent implicit approaches and outperforms state-of-the-art discrete methods with over 10x fewer parameters. Our method also demonstrates superior data efficiency and improved robustness to data shifts across image resolutions and datasets. Code is available on Github (https://github.com/charzharr/miccai23-swipe-implicit-segmentation).
- Abstract(参考訳): 現代の医用画像分割法は、主にラスタ化マスクの形で離散表現を使用して特徴を学習し、予測を生成する。
効果はあるものの、このパラダイムは空間的に非フレキシブルであり、高解像度の画像にはスケールが悪く、物体の形状を直接理解できない。
これらの制限に対処するため、最近の研究では暗黙のニューラル表現(INR)を使用してセグメンテーションの連続表現を学習している。
しかし、これらの手法は3次元形状復元のために設計された部品を直接採用することが多い。
より重要なことは、これらの定式化は点ベースまたは大域的文脈に制約され、文脈的理解や局所的詳細が欠如しており、それぞれ正確なセグメンテーションに不可欠である。これを改善するために、INRの利点を活用してパッチレベルでの形状を予測するSwIPE(Segmentation with Implicit Patch Embeddings)という新しいアプローチを提案する。
2つの課題(2次元ポリープ分割と3次元腹部臓器分割)の広範囲な評価は、SwIPEが最近の暗黙的アプローチよりも著しく改善し、10倍以上のパラメータで最先端の離散的手法より優れていることを示している。
また,画像の解像度やデータセット間のデータシフトに対して,データ効率の向上とロバスト性の向上が図られている。
コードはGithubで入手できる(https://github.com/charzharr/miccai23-swipe-implicit-segmentation)。
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