論文の概要: Topologically Regularized Multiple Instance Learning to Harness Data
Scarcity
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.14025v2
- Date: Mon, 11 Mar 2024 11:14:15 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-13 16:36:03.414106
- Title: Topologically Regularized Multiple Instance Learning to Harness Data
Scarcity
- Title(参考訳): データ不足を活用したトポロジカル正規化マルチインスタンス学習
- Authors: Salome Kazeminia, Carsten Marr, Bastian Rieck
- Abstract要約: 複数のインスタンス学習モデルは、患者の顕微鏡サンプルを分類するための強力なツールとして登場した。
我々は、この課題を緩和するために、MILにトポロジカル正規化用語を導入します。
MILベンチマークは平均2.8%、合成MILデータセットは15.3%、現実世界のバイオメディカルデータセットは5.5%である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 15.06687736543614
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: In biomedical data analysis, Multiple Instance Learning (MIL) models have
emerged as a powerful tool to classify patients' microscopy samples. However,
the data-intensive requirement of these models poses a significant challenge in
scenarios with scarce data availability, e.g., in rare diseases. We introduce a
topological regularization term to MIL to mitigate this challenge. It provides
a shape-preserving inductive bias that compels the encoder to maintain the
essential geometrical-topological structure of input bags during projection
into latent space. This enhances the performance and generalization of the MIL
classifier regardless of the aggregation function, particularly for scarce
training data. The effectiveness of our method is confirmed through experiments
across a range of datasets, showing an average enhancement of 2.8% for MIL
benchmarks, 15.3% for synthetic MIL datasets, and 5.5% for real-world
biomedical datasets over the current state-of-the-art.
- Abstract(参考訳): バイオメディカルデータ分析において、MILモデルは患者の顕微鏡サンプルを分類するための強力なツールとして登場した。
しかし、これらのモデルのデータ集約的な要求は、稀な疾患など、データ可用性の低いシナリオにおいて重大な課題となる。
この課題を緩和するために、milにトポロジカル正規化用語を導入する。
形状保存誘導バイアスを提供し、エンコーダを補完し、潜時空間への射影中に入力バッグの基本的な幾何学的位相構造を維持する。
これにより、特に訓練データが少ない場合、集約機能に関係なく、ミル分類器の性能と一般化が向上する。
本手法の有効性は,MILベンチマークの2.8%,合成MILデータセットの15.3%,バイオメディカルデータセットの5.5%など,さまざまなデータセットを対象とした実験を通じて確認された。
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