論文の概要: Artifact Restoration in Histology Images with Diffusion Probabilistic
Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.14262v1
- Date: Wed, 26 Jul 2023 15:50:02 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-07-27 11:59:56.753088
- Title: Artifact Restoration in Histology Images with Diffusion Probabilistic
Models
- Title(参考訳): 拡散確率モデルを用いた組織像のアーティファクト復元
- Authors: Zhenqi He, Junjun He, Jin Ye, Yiqing Shen
- Abstract要約: 組織学的全スライド画像(WSI)は通常、組織の折り畳みや気泡などの人工物によって妥協される。
既存のアーティファクト画像復元手法はGAN(Generative Adversarial Networks)に限られている
組織学的アーティファクト修復(ArtiFusion)のための拡散確率モデルの最初の試みを行う。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 10.016731839549259
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Histological whole slide images (WSIs) can be usually compromised by
artifacts, such as tissue folding and bubbles, which will increase the
examination difficulty for both pathologists and Computer-Aided Diagnosis (CAD)
systems. Existing approaches to restoring artifact images are confined to
Generative Adversarial Networks (GANs), where the restoration process is
formulated as an image-to-image transfer. Those methods are prone to suffer
from mode collapse and unexpected mistransfer in the stain style, leading to
unsatisfied and unrealistic restored images. Innovatively, we make the first
attempt at a denoising diffusion probabilistic model for histological artifact
restoration, namely ArtiFusion.Specifically, ArtiFusion formulates the artifact
region restoration as a gradual denoising process, and its training relies
solely on artifact-free images to simplify the training complexity.Furthermore,
to capture local-global correlations in the regional artifact restoration, a
novel Swin-Transformer denoising architecture is designed, along with a time
token scheme. Our extensive evaluations demonstrate the effectiveness of
ArtiFusion as a pre-processing method for histology analysis, which can
successfully preserve the tissue structures and stain style in artifact-free
regions during the restoration. Code is available at
https://github.com/zhenqi-he/ArtiFusion.
- Abstract(参考訳): 組織学的全スライド画像(WSI)は通常、組織折り畳みや気泡などの人工物によって妥協され、病理医とコンピュータ支援診断(CAD)システムの検査困難が増大する。
既存のアーティファクトイメージの復元アプローチはGAN(Generative Adversarial Networks)に限られており、修復プロセスはイメージ・ツー・イメージ・トランスファーとして定式化されている。
これらの手法は、モード崩壊と予期せぬステンスタイルの誤伝に苦しむ傾向があり、不満足で非現実的な復元画像を生み出す。
Innovatively, we make the first attempt at a denoising diffusion probabilistic model for histological artifact restoration, namely ArtiFusion.Specifically, ArtiFusion formulates the artifact region restoration as a gradual denoising process, and its training relies solely on artifact-free images to simplify the training complexity.Furthermore, to capture local-global correlations in the regional artifact restoration, a novel Swin-Transformer denoising architecture is designed, along with a time token scheme.
本研究は, 組織解析におけるArtiFusionの予備処理法としての有効性を実証し, 修復過程における組織構造と染色様式の保存に成功した。
コードはhttps://github.com/zhenqi-he/artifusionで入手できる。
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