論文の概要: Matching Patients to Clinical Trials with Large Language Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.15051v3
- Date: Sat, 20 Apr 2024 16:31:09 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-04-24 01:02:16.555080
- Title: Matching Patients to Clinical Trials with Large Language Models
- Title(参考訳): 言語モデルを用いた患者と臨床の整合性の検討
- Authors: Qiao Jin, Zifeng Wang, Charalampos S. Floudas, Fangyuan Chen, Changlin Gong, Dara Bracken-Clarke, Elisabetta Xue, Yifan Yang, Jimeng Sun, Zhiyong Lu,
- Abstract要約: 本稿では,患者間マッチングを支援するLLMフレームワークTrialGPTを紹介する。
患者注記が与えられた場合、TrialGPTは基準に基づいて患者の適性を予測する。
公用コホート184例を対象に,TrialGPTの試験レベル予測性能について検討した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 29.265158319106604
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Clinical trials are often hindered by the challenge of patient recruitment. In this work, we introduce TrialGPT, a first-of-its-kind large language model (LLM) framework to assist patient-to-trial matching. Given a patient note, TrialGPT predicts the patient's eligibility on a criterion-by-criterion basis and then consolidates these predictions to assess the patient's eligibility for the target trial. We evaluate the trial-level prediction performance of TrialGPT on three publicly available cohorts of 184 patients with over 18,000 trial annotations. We also engaged three physicians to label over 1,000 patient-criterion pairs to assess its criterion-level prediction accuracy. Experimental results show that TrialGPT achieves a criterion-level accuracy of 87.3% with faithful explanations, close to the expert performance (88.7%-90.0%). The aggregated TrialGPT scores are highly correlated with human eligibility judgments, and they outperform the best-competing models by 32.6% to 57.2% in ranking and excluding clinical trials. Furthermore, our user study reveals that TrialGPT can significantly reduce the screening time (by 42.6%) in a real-life clinical trial matching task. These results and analyses have demonstrated promising opportunities for clinical trial matching with LLMs such as TrialGPT.
- Abstract(参考訳): 臨床試験は、しばしば患者募集の課題によって妨げられる。
本稿では,患者間マッチングを支援するLLMフレームワークであるTrialGPTを紹介する。
患者注記が与えられた場合、TrialGPTは、患者が基準ごとの基準に基づいて適性を予測するとともに、これらの予測を統合して、対象の臨床試験に対する適性を評価する。
公用コホート184例を対象に,TrialGPTの試験レベル予測性能について検討した。
また,3名の医師に1,000名以上の患者基準ペアをラベル付けし,基準レベルの予測精度を評価した。
実験の結果、TrialGPTは専門家のパフォーマンス(88.7%-90.0%)に近く、忠実な説明で87.3%の基準レベルの精度を達成した。
集計されたTrialGPTスコアは、ヒトの適性判断と高い相関があり、最高の競争モデルを32.6%から57.2%で上回り、臨床試験を除外している。
さらに,本研究により,TrialGPTは実生活における臨床試験マッチング作業において,スクリーニング時間(42.6%)を大幅に短縮できることが明らかとなった。
これらの結果と分析により,TrialGPTなどのLSMとの臨床治験の機会が得られた。
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