論文の概要: Synthetic Skull CT Generation with Generative Adversarial Networks to
Train Deep Learning Models for Clinical Transcranial Ultrasound
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.00206v3
- Date: Thu, 1 Feb 2024 04:56:50 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-02-02 19:24:55.275894
- Title: Synthetic Skull CT Generation with Generative Adversarial Networks to
Train Deep Learning Models for Clinical Transcranial Ultrasound
- Title(参考訳): 医用経頭蓋超音波の深部学習モデルトレーニングのための生成逆ネットワークを用いた合成スカルCT生成
- Authors: Kasra Naftchi-Ardebili, Karanpartap Singh, Reza Pourabolghasem, Pejman
Ghanouni, Gerald R. Popelka, Kim Butts Pauly
- Abstract要約: そこで我々は,合成頭蓋骨CTスライスの大きなデータセットを作成するために,合成対向ネットワーク(SkullGAN)を提案する。
主な障害は、訓練のために十分な頭蓋骨CTスライスがないことである。
SkullGANは、研究者が大量の合成頭蓋骨のCTセグメントを生成することを可能にする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Deep learning offers potential for various healthcare applications, yet
requires extensive datasets of curated medical images where data privacy, cost,
and distribution mismatch across various acquisition centers could become major
problems. To overcome these challenges, we propose a generative adversarial
network (SkullGAN) to create large datasets of synthetic skull CT slices,
geared towards training models for transcranial ultrasound. With wide ranging
applications in treatment of essential tremor, Parkinson's, and Alzheimer's
disease, transcranial ultrasound clinical pipelines can be significantly
optimized via integration of deep learning. The main roadblock is the lack of
sufficient skull CT slices for the purposes of training, which SkullGAN aims to
address. Actual CT slices of 38 healthy subjects were used for training. The
generated synthetic skull images were then evaluated based on skull density
ratio, mean thickness, and mean intensity. Their fidelity was further analyzed
using t-distributed stochastic neighbor embedding (t-SNE), Fr\'echet inception
distance (FID) score, and visual Turing test (VTT) taken by four staff clinical
radiologists. SkullGAN-generated images demonstrated similar quantitative
radiological features to real skulls. t-SNE failed to separate real and
synthetic samples from one another, and the FID score was 49. Expert
radiologists achieved a 60\% mean accuracy on the VTT. SkullGAN makes it
possible for researchers to generate large numbers of synthetic skull CT
segments, necessary for training neural networks for medical applications
involving the human skull, such as transcranial focused ultrasound, mitigating
challenges with access, privacy, capital, time, and the need for domain
expertise.
- Abstract(参考訳): ディープラーニングは、さまざまなヘルスケアアプリケーションに潜在的な可能性を提供するが、データプライバシ、コスト、およびさまざまな買収センター間の分散ミスマッチが大きな問題となるような、キュレートされた医療画像の広範なデータセットを必要とする。
これらの課題を克服するために, 人工頭蓋骨のCTスライスを大規模にデータセット化し, 経頭蓋骨超音波の訓練モデルを構築するために, SkullGAN (Generative Adversarial Network) を提案する。
本態性振動、パーキンソン病、アルツハイマー病の治療における幅広い応用により、経頭蓋超音波臨床パイプラインは深層学習の統合により大幅に最適化できる。
主な障害は、訓練のために十分な頭蓋骨のCTスライスがないことだ。
健常者38名のCTスライスをトレーニングに使用した。
得られた合成頭蓋骨画像は, 頭蓋密度比, 平均厚さ, 平均強度に基づいて評価した。
t-sne(t-distributed stochastic neighbor embedded)、fid(fr\'echet inception distance)スコア(fr\'echet inception distance)、vtt(visual turing test)の4人のスタッフによる分析を行った。
SkullGANにより生成された画像は、実際の頭蓋骨と同様の定量的な放射線学的特徴を示した。
t-sneは実試料と合成試料の分離に失敗し,fidスコアは49。
専門医はVTTの平均精度を60倍に向上した。
skullganは、人間の頭蓋骨に焦点をあてた超音波のような医療応用のためのニューラルネットワークのトレーニング、アクセス、プライバシー、資本、時間、ドメイン専門知識の必要性の軽減などに必要な、大量の合成頭蓋骨ctセグメントを研究者が生成可能にする。
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