論文の概要: Method for Generating Synthetic Data Combining Chest Radiography Images
with Tabular Clinical Information Using Dual Generative Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.07573v2
- Date: Tue, 19 Sep 2023 00:42:29 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-09-20 19:10:09.842879
- Title: Method for Generating Synthetic Data Combining Chest Radiography Images
with Tabular Clinical Information Using Dual Generative Models
- Title(参考訳): 胸部X線画像と胸部臨床情報を組み合わせた二重生成モデルを用いた合成データ生成法
- Authors: Tomohiro Kikuchi, Shouhei Hanaoka, Takahiro Nakao, Tomomi Takenaga,
Yukihiro Nomura, Harushi Mori, Takeharu Yoshikawa
- Abstract要約: 画像データと非画像データを組み合わせた合成ハイブリッド医療記録を作成する新しい手法を提案する。
胸部X線(CXR)と13の非画像的臨床変数を併用した合成記録の作成に成功した。
本手法は,セカンダリデータ利用の可能性を損なうことなく,人工データセットの公開を約束する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.1884913108327873
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: The generation of synthetic medical records using Generative Adversarial
Networks (GANs) is becoming crucial for addressing privacy concerns and
facilitating data sharing in the medical domain. In this paper, we introduce a
novel method to create synthetic hybrid medical records that combine both image
and non-image data, utilizing an auto-encoding GAN (alphaGAN) and a conditional
tabular GAN (CTGAN). Our methodology encompasses three primary steps: I)
Dimensional reduction of images in a private dataset (pDS) using the pretrained
encoder of the {\alpha}GAN, followed by integration with the remaining
non-image clinical data to form tabular representations; II) Training the CTGAN
on the encoded pDS to produce a synthetic dataset (sDS) which amalgamates
encoded image features with non-image clinical data; and III) Reconstructing
synthetic images from the image features using the alphaGAN's pretrained
decoder. We successfully generated synthetic records incorporating both Chest
X-Rays (CXRs) and thirteen non-image clinical variables (comprising seven
categorical and six numeric variables). To evaluate the efficacy of the sDS, we
designed classification and regression tasks and compared the performance of
models trained on pDS and sDS against the pDS test set. Remarkably, by
leveraging five times the volume of sDS for training, we achieved
classification and regression results that were comparable, if slightly
inferior, to those obtained using the native pDS. Our method holds promise for
publicly releasing synthetic datasets without undermining the potential for
secondary data usage.
- Abstract(参考訳): GAN(Generative Adversarial Networks)を用いた合成医療記録の生成は,プライバシの懸念に対処し,医療領域におけるデータ共有を促進する上で重要である。
本稿では,画像データと非画像データを組み合わせた合成ハイブリッド医療記録を作成する手法について,自動符号化GAN(alphaGAN)と条件付き表状GAN(CTGAN)を用いて紹介する。
Our methodology encompasses three primary steps: I) Dimensional reduction of images in a private dataset (pDS) using the pretrained encoder of the {\alpha}GAN, followed by integration with the remaining non-image clinical data to form tabular representations; II) Training the CTGAN on the encoded pDS to produce a synthetic dataset (sDS) which amalgamates encoded image features with non-image clinical data; and III) Reconstructing synthetic images from the image features using the alphaGAN's pretrained decoder.
胸部x線 (cxrs) と非画像臨床変数 (7つのカテゴリと6つの数値変数) を併用した合成記録の作成に成功した。
sDSの有効性を評価するため,分類および回帰タスクを設計し,pDSおよびsDSで訓練されたモデルの性能をpDSテストセットと比較した。
また,SDSの5倍のボリュームをトレーニングに利用することにより,ネイティブpDSに比べてわずかに劣る分類と回帰結果を得た。
本手法は,セカンダリデータ利用の可能性を損なうことなく,人工データセットの公開を約束する。
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