論文の概要: Multi-feature concatenation and multi-classifier stacking: an
interpretable and generalizable machine learning method for MDD
discrimination with rsfMRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.09360v1
- Date: Fri, 18 Aug 2023 07:40:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-08-21 14:06:13.144870
- Title: Multi-feature concatenation and multi-classifier stacking: an
interpretable and generalizable machine learning method for MDD
discrimination with rsfMRI
- Title(参考訳): 多機能結合とマルチクラス化 : rsfmriを用いたmdd識別のための解釈可能・一般化型機械学習手法
- Authors: Yunsong Luo, Wenyu Chen, Ling Zhan, Jiang Qiu, Tao Jia
- Abstract要約: 機械学習アルゴリズムは、RSfMRIの豊富な情報を活用し、MDD患者を正常なコントロールから識別するために開発された。
本稿では、複数の特徴を連結し、複数の分類器を積み重ねることでMDD識別のための機械学習手法(MFMC)を提案する。
MFMCは96.9%のMDD識別精度を示し、既存の方法よりも大幅に改善されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.920725855810074
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Major depressive disorder is a serious and heterogeneous psychiatric disorder
that needs accurate diagnosis. Resting-state functional MRI (rsfMRI), which
captures multiple perspectives on brain structure, function, and connectivity,
is increasingly applied in the diagnosis and pathological research of mental
diseases. Different machine learning algorithms are then developed to exploit
the rich information in rsfMRI and discriminate MDD patients from normal
controls. Despite recent advances reported, the discrimination accuracy has
room for further improvement. The generalizability and interpretability of the
method are not sufficiently addressed either. Here, we propose a machine
learning method (MFMC) for MDD discrimination by concatenating multiple
features and stacking multiple classifiers. MFMC is tested on the REST-meta-MDD
data set that contains 2428 subjects collected from 25 different sites. MFMC
yields 96.9% MDD discrimination accuracy, demonstrating a significant
improvement over existing methods. In addition, the generalizability of MFMC is
validated by the good performance when the training and testing subjects are
from independent sites. The use of XGBoost as the meta classifier allows us to
probe the decision process of MFMC. We identify 13 feature values related to 9
brain regions including the posterior cingulate gyrus, superior frontal gyrus
orbital part, and angular gyrus, which contribute most to the classification
and also demonstrate significant differences at the group level. The use of
these 13 feature values alone can reach 87% of MFMC's full performance when
taking all feature values. These features may serve as clinically useful
diagnostic and prognostic biomarkers for mental disorders in the future.
- Abstract(参考訳): うつ病は重度で異質な精神疾患であり、正確な診断が必要である。
精神疾患の診断や病理研究において、脳の構造、機能、接続性に関する複数の視点を捉えた静止状態機能MRI (rsfMRI) がますます応用されている。
異なる機械学習アルゴリズムが開発され、RSfMRIの豊富な情報を活用し、MDD患者を正常なコントロールから識別する。
最近の進歩にもかかわらず、識別精度はさらなる改善の余地がある。
この手法の一般化可能性や解釈性も十分ではない。
本稿では、複数の特徴を連結し、複数の分類器を積み重ねることでMDD識別のための機械学習手法(MFMC)を提案する。
mfmcは25の異なるサイトから集められた2428の被験者を含むrest-meta-mddデータセット上でテストされる。
MFMCは96.9%のMDD識別精度を示し、既存の方法よりも大幅に改善されている。
さらに,MFMCの総合化性は,訓練対象と試験対象が独立したサイトである場合に,優れた性能で検証される。
メタ分類器としてXGBoostを使用することで、MFMCの決定過程を探索することができる。
本研究は, 後帯状回, 前頭回軌道上部, 角回を含む9つの脳領域に関連する13の特徴を同定し, 分類に最も寄与し, 群レベルでの有意な差異を示した。
これらの13の機能値だけで、すべての機能値を取る場合、MFMCの完全なパフォーマンスの87%に達することができる。
これらの特徴は、将来、精神疾患の診断および予後のバイオマーカーとして臨床的に有用である。
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