論文の概要: Switched auxiliary loss for robust training of transformer models for histopathological image segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.10994v2
- Date: Wed, 14 Aug 2024 11:54:05 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-08-15 18:36:49.480664
- Title: Switched auxiliary loss for robust training of transformer models for histopathological image segmentation
- Title(参考訳): 組織像分割のための変圧器モデルのロバストトレーニングのための切替補助損失
- Authors: Mustaffa Hussain, Saharsh Barve,
- Abstract要約: 機能組織ユニット(英: functional tissue Units, FTUs)は、その主な機能を実行する特定の器官に近接する細胞集団である。
我々は,「HuBMAP + HPA - Hacking the Human Body」コンペティションデータセットを利用して,5臓器に複数臓器のFTUを分割するモデルを開発した。
我々のモデルは、公開データセットで0.793、プライベートデータセットで0.778のダイススコアを達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.060467329188882764
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Functional tissue Units (FTUs) are cell population neighborhoods local to a particular organ performing its main function.The FTUs provide crucial information to the pathologist in understanding the disease affecting a particular organ by providing information at the cellular level.In our research, we have developed a model to segment multi-organ FTUs across 5 organs namely: the kidney, large intestine, lung, prostate and spleen by utilizing the 'HuBMAP + HPA - Hacking the Human Body' competition dataset.We propose adding switched auxiliary loss for training models like the transformers to overcome the diminishing gradient problem which poses a challenge towards optimal training of deep models.Overall, our model achieved a dice score of 0.793 on the public dataset and 0.778 on the private dataset.The results supports the robustness of the proposed training methodology.The findings also bolster the use of transformers models for dense prediction tasks in the field of medical image analysis.The study assists in understanding the relationships between cell and tissue organization thereby providing a useful medium to look at the impact of cellular functions on human health.
- Abstract(参考訳): 機能組織ユニット(FTU)は、その機能を行う特定の臓器に局所的な細胞集団である。FTUは、細胞レベルで情報を提供することで、特定の臓器に影響を及ぼす疾患を理解する上で、病理学者に重要な情報を提供する。我々は、「HuBMAP+HPA-HuBMAP-HPA-HPA-HuBMAP-HPA-HuBMAP+HPA-HuBMAP+HPA-HuBMAP-HuBMAP+HPA-HuBMAP-HuBMAP+HPA-HuBMAP-HuBMAP+HPA-HuBMAP-HuBMAP-HuBMAP-HuBMAP+HPA-HuBMAP-HuBMAP-HuBMAP+HPA-HuBMAP-HuBMAP-HuBMAP-HuBMAP-HuBMAP-HPA-HuBMAP-HuBMAP-HuBMAP-HuBMAP-HuBMAP-HuBMAP-HuBMAP-HuBMAP-H uBMAP-HPA-HPA-HuBMAP-HuBMAP-HPA-HuBMAP-HPA-HuBMAP)を用いて、多臓器FTUを5臓器に分割するモデルを開発した。
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