論文の概要: Learned Local Attention Maps for Synthesising Vessel Segmentations
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.12861v1
- Date: Thu, 24 Aug 2023 15:32:27 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-08-25 13:38:17.656523
- Title: Learned Local Attention Maps for Synthesising Vessel Segmentations
- Title(参考訳): 容器セグメンテーション合成のための局所注意マップの学習
- Authors: Yash Deo, Rodrigo Bonazzola, Haoran Dou, Yan Xia, Tianyou Wei, Nishant
Ravikumar, Alejandro F. Frangi, Toni Lassila
- Abstract要約: 我々は、T2 MRIのみから、Willis(CoW)円の主大脳動脈の分節を合成するためのエンコーダ・デコーダモデルを提案する。
これは、セグメンテーションラベルを拡張することによって生成された学習されたローカルアテンションマップを使用し、ネットワークはCoWの合成に関連するT2 MRIからのみ情報を抽出する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 43.314353195417326
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Magnetic resonance angiography (MRA) is an imaging modality for visualising
blood vessels. It is useful for several diagnostic applications and for
assessing the risk of adverse events such as haemorrhagic stroke (resulting
from the rupture of aneurysms in blood vessels). However, MRAs are not acquired
routinely, hence, an approach to synthesise blood vessel segmentations from
more routinely acquired MR contrasts such as T1 and T2, would be useful. We
present an encoder-decoder model for synthesising segmentations of the main
cerebral arteries in the circle of Willis (CoW) from only T2 MRI. We propose a
two-phase multi-objective learning approach, which captures both global and
local features. It uses learned local attention maps generated by dilating the
segmentation labels, which forces the network to only extract information from
the T2 MRI relevant to synthesising the CoW. Our synthetic vessel segmentations
generated from only T2 MRI achieved a mean Dice score of $0.79 \pm 0.03$ in
testing, compared to state-of-the-art segmentation networks such as transformer
U-Net ($0.71 \pm 0.04$) and nnU-net($0.68 \pm 0.05$), while using only a
fraction of the parameters. The main qualitative difference between our
synthetic vessel segmentations and the comparative models was in the sharper
resolution of the CoW vessel segments, especially in the posterior circulation.
- Abstract(参考訳): 磁気共鳴血管造影(MRA)は血管の可視化のための画像モダリティである。
いくつかの診断応用に有用であり、出血性脳卒中(血管の動脈瘤破裂からの回復)などの有害事象のリスクを評価するのに有用である。
しかし、MRAは日常的に取得されないため、T1やT2のようなより日常的に取得されたMRコントラストから血管のセグメンテーションを合成するアプローチは有用である。
我々は、T2 MRIのみから、Willis(CoW)円の主大脳動脈の分節を合成するためのエンコーダ・デコーダモデルを提案する。
グローバルとローカル両方の特徴を捉える2段階多目的学習手法を提案する。
これは、セグメンテーションラベルを拡張することによって生成された学習されたローカルアテンションマップを使用し、ネットワークはCoW合成に関連するT2 MRIからのみ情報を抽出する。
T2 MRIで生成した人工血管のセグメンテーションは, トランスフォーマーU-Net(0.71 pm 0.04$)やnnU-net(0.68 pm 0.05$)のような最先端のセグメンテーションネットワークと比較して, 平均Diceスコアが0.79 pm 0.03$となった。
人工血管のセグメンテーションと比較モデルの主な定性的な違いは,特に後部循環におけるCoW血管セグメンテーションのシャープな分解能であった。
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