論文の概要: Compressor-Based Classification for Atrial Fibrillation Detection
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2308.13328v2
- Date: Mon, 2 Oct 2023 09:56:00 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-10-03 16:53:59.514828
- Title: Compressor-Based Classification for Atrial Fibrillation Detection
- Title(参考訳): 心房細動検出のための圧縮機に基づく分類
- Authors: Nikita Markov, Konstantin Ushenin, Yakov Bozhko, Olga Solovyova
- Abstract要約: 心房細動(英: atrial fibrillation、AF)は、公衆衛生に問題のある最も一般的な不整脈の1つである。
本稿では,AF検出のためのgzipアルゴリズムを用いて,最近導入された圧縮機によるテキスト分類手法を適用した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Atrial fibrillation (AF) is one of the most common arrhythmias with
challenging public health implications. Therefore, automatic detection of AF
episodes on ECG is one of the essential tasks in biomedical engineering. In
this paper, we applied the recently introduced method of compressor-based text
classification with gzip algorithm for AF detection (binary classification
between heart rhythms). We investigated the normalized compression distance
applied to RR-interval and $\Delta$RR-interval sequences ($\Delta$RR-interval
is the difference between subsequent RR-intervals). Here, the configuration of
the k-nearest neighbour classifier, an optimal window length, and the choice of
data types for compression were analyzed. We achieved good classification
results while learning on the full MIT-BIH Atrial Fibrillation database, close
to the best specialized AF detection algorithms (avg. sensitivity = 97.1\%,
avg. specificity = 91.7\%, best sensitivity of 99.8\%, best specificity of
97.6\% with fivefold cross-validation). In addition, we evaluated the
classification performance under the few-shot learning setting. Our results
suggest that gzip compression-based classification, originally proposed for
texts, is suitable for biomedical data and quantized continuous stochastic
sequences in general.
- Abstract(参考訳): 心房細動(英: atrial fibrillation、AF)は、公衆衛生に問題のある最も一般的な不整脈の1つである。
したがって,ecgにおけるafエピソードの自動検出は,生体工学における重要な課題の一つである。
本稿では,近年導入された圧縮機を用いたテキスト分類法を,AF検出のためのgzipアルゴリズムを用いて適用した。
RR-interval と $\Delta$RR-interval に適用される正規化圧縮距離 ($\Delta$RR-interval is the difference between subsequent RR-intervals) について検討した。
そこで、k-nearest近傍の分類器の構成、最適なウィンドウ長、圧縮のためのデータ型の選択について分析した。
mit-bih心房細動データベース(avg:best special af detection algorithm)を用いて,良好な分類結果を得た。
感度 = 97.1\%,avg。
特異度=91.7\%、最良の感度:99.8\%、最良の特異度:97.6\%。
さらに,マイズショット学習環境下での分類性能の評価を行った。
この結果から,gzip圧縮に基づく分類は,生医学的データや量子化された連続確率列に適していると考えられた。
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