論文の概要: DARC: Distribution-Aware Re-Coloring Model for Generalizable Nucleus
Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2309.00188v1
- Date: Fri, 1 Sep 2023 01:01:13 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-09-04 14:50:05.087617
- Title: DARC: Distribution-Aware Re-Coloring Model for Generalizable Nucleus
Segmentation
- Title(参考訳): DARC: 一般化可能な核分割のための分布認識再構成モデル
- Authors: Shengcong Chen, Changxing Ding, Dacheng Tao, Hao Chen
- Abstract要約: ドメインギャップは、異なるフォアグラウンド(核)-バックグラウンド比によっても引き起こされる可能性があると我々は主張する。
まず、異なる領域間の劇的な画像色変化を緩和する再カラー化手法を提案する。
次に,前景-背景比の変動に頑健な新しいインスタンス正規化手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 68.43628183890007
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Nucleus segmentation is usually the first step in pathological image analysis
tasks. Generalizable nucleus segmentation refers to the problem of training a
segmentation model that is robust to domain gaps between the source and target
domains. The domain gaps are usually believed to be caused by the varied image
acquisition conditions, e.g., different scanners, tissues, or staining
protocols. In this paper, we argue that domain gaps can also be caused by
different foreground (nucleus)-background ratios, as this ratio significantly
affects feature statistics that are critical to normalization layers. We
propose a Distribution-Aware Re-Coloring (DARC) model that handles the above
challenges from two perspectives. First, we introduce a re-coloring method that
relieves dramatic image color variations between different domains. Second, we
propose a new instance normalization method that is robust to the variation in
foreground-background ratios. We evaluate the proposed methods on two H$\&$E
stained image datasets, named CoNSeP and CPM17, and two IHC stained image
datasets, called DeepLIIF and BC-DeepLIIF. Extensive experimental results
justify the effectiveness of our proposed DARC model. Codes are available at
\url{https://github.com/csccsccsccsc/DARC
- Abstract(参考訳): 核セグメンテーションは通常、病理画像解析タスクの第一段階である。
一般化可能な核分割は、ソースとターゲットドメイン間のドメインギャップに対して堅牢なセグメンテーションモデルをトレーニングする問題を指す。
ドメインギャップは通常、様々なスキャナー、組織、染色プロトコルなどの様々な画像取得条件によって引き起こされると考えられている。
本稿では,この比率が正規化層に重要な特徴統計に大きく影響するため,前景(核)-裏面比の違いによってもドメインギャップが生じる可能性があることを論じる。
本稿では,上記の課題を2つの視点から扱うDARCモデルを提案する。
まず,異なる領域間の劇的な画像色変化を緩和する再彩色法を提案する。
次に,前景-背景比の変動に頑健な新しいインスタンス正規化手法を提案する。
我々は,2つのH$\&$E染色画像データセットであるCoNSePとCPM17と,DeepLIIFとBC-DeepLIIFという2つのIHC染色画像データセットについて評価を行った。
DARCモデルの有効性を定量的に検証した。
コードは \url{https://github.com/csccsccsccsc/DARC
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