論文の概要: Virchow: A Million-Slide Digital Pathology Foundation Model

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2309.07778v5
• Date: Thu, 18 Jan 2024 03:55:30 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2024-01-19 20:09:54.127472
• Title: Virchow: A Million-Slide Digital Pathology Foundation Model
• Title（参考訳）: Virchow:100万ドルのデジタル病理モデル
• Authors: Eugene Vorontsov, Alican Bozkurt, Adam Casson, George Shaikovski, Michal Zelechowski, Siqi Liu, Kristen Severson, Eric Zimmermann, James Hall, Neil Tenenholtz, Nicolo Fusi, Philippe Mathieu, Alexander van Eck, Donghun Lee, Julian Viret, Eric Robert, Yi Kan Wang, Jeremy D. Kunz, Matthew C. H. Lee, Jan Bernhard, Ran A. Godrich, Gerard Oakley, Ewan Millar, Matthew Hanna, Juan Retamero, William A. Moye, Razik Yousfi, Christopher Kanan, David Klimstra, Brandon Rothrock, Thomas J. Fuchs
• Abstract要約: 本稿では,コンピュータ病理学の基礎モデルであるVirchowを紹介する。 Virchowは、150万のヘマトキシリンとエオシン染色されたスライドイメージに基づいて、632万のパラメータをトレーニングしたビジョントランスフォーマーモデルである。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 34.38679208931425
• License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
• Abstract: The use of artificial intelligence to enable precision medicine and decision support systems through the analysis of pathology images has the potential to revolutionize the diagnosis and treatment of cancer. Such applications will depend on models' abilities to capture the diverse patterns observed in pathology images. To address this challenge, we present Virchow, a foundation model for computational pathology. Using self-supervised learning empowered by the DINOv2 algorithm, Virchow is a vision transformer model with 632 million parameters trained on 1.5 million hematoxylin and eosin stained whole slide images from diverse tissue and specimen types, which is orders of magnitude more data than previous works. The Virchow model enables the development of a pan-cancer detection system with 0.949 overall specimen-level AUC across 17 different cancer types, while also achieving 0.937 AUC on 7 rare cancer types. The Virchow model sets the state-of-the-art on the internal and external image tile level benchmarks and slide level biomarker prediction tasks. The gains in performance highlight the importance of training on massive pathology image datasets, suggesting scaling up the data and network architecture can improve the accuracy for many high-impact computational pathology applications where limited amounts of training data are available.
• Abstract（参考訳）: 病理画像解析による精密医療と意思決定支援システムを実現する人工知能の利用は、がんの診断と治療に革命をもたらす可能性がある。 このような応用は、病理画像で観察される多様なパターンをキャプチャするモデルの能力に依存する。 この課題に対処するために,計算病理学の基礎モデルである virchow を提案する。 VirchowはDINOv2アルゴリズムによって強化された自己教師型学習を用いて、150万のヘマトキシリンとエオシンでトレーニングされた6億2200万のパラメータを持つビジョントランスフォーマーモデルである。 Virchowモデルにより、17種類の癌に対して0.949の検体レベルAUCを持つ膵臓検出システムの開発が可能となり、7種類のまれな癌に対して0.937のAUCを達成できる。 Virchowモデルは、内部および外部画像タイルレベルのベンチマークとスライドレベルのバイオマーカー予測タスクに最先端を設定します。 データとネットワークアーキテクチャのスケールアップは、限られた量のトレーニングデータが利用可能な多くのハイインパクトな計算病理アプリケーションにおいて、精度を向上させることを示唆している。

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