論文の概要: Text Classification of Cancer Clinical Trial Eligibility Criteria
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2309.07812v2
- Date: Fri, 15 Sep 2023 21:59:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-09-19 10:08:10.801971
- Title: Text Classification of Cancer Clinical Trial Eligibility Criteria
- Title(参考訳): がん治験適性基準のテキスト分類
- Authors: Yumeng Yang, Soumya Jayaraj, Ethan B Ludmir, Kirk Roberts
- Abstract要約: 悪性腫瘍,ヒト免疫不全ウイルス,B型肝炎,C型肝炎,精神疾患,薬物・物質乱用,自己免疫疾患の7つの共通排除基準に注目した。
本データセットは,第764相臨床試験からなり,これらの除外は試験レベルでアノテートされる。
以上の結果から,共通排他基準を自動分類できる可能性が示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.372747046563984
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Automatic identification of clinical trials for which a patient is eligible
is complicated by the fact that trial eligibility is stated in natural
language. A potential solution to this problem is to employ text classification
methods for common types of eligibility criteria. In this study, we focus on
seven common exclusion criteria in cancer trials: prior malignancy, human
immunodeficiency virus, hepatitis B, hepatitis C, psychiatric illness,
drug/substance abuse, and autoimmune illness. Our dataset consists of 764 phase
III cancer trials with these exclusions annotated at the trial level. We
experiment with common transformer models as well as a new pre-trained clinical
trial BERT model. Our results demonstrate the feasibility of automatically
classifying common exclusion criteria. Additionally, we demonstrate the value
of a pre-trained language model specifically for clinical trials, which yields
the highest average performance across all criteria.
- Abstract(参考訳): 患者が対象とする臨床試験の自動識別は、治験適格性が自然言語で記述されているという事実によって複雑である。
この問題の潜在的な解決策は、共通タイプの適格基準にテキスト分類法を採用することである。
本研究では,術前悪性腫瘍,ヒト免疫不全ウイルス,B型肝炎,C型肝炎,精神疾患,薬物・物質乱用,自己免疫疾患の7つの共通排除基準に焦点を当てた。
本データセットは,第764相臨床試験からなり,これらの除外は試験レベルでアノテートされる。
本研究は,新規にトレーニング済み臨床試験 BERT モデルとともに,共通のトランスフォーマーモデルを用いて実験を行った。
本結果は, 排除基準の自動分類の可能性を示した。
さらに,臨床試験に特化する事前学習された言語モデルの価値を実証し,すべての基準で最高の平均性能が得られることを示した。
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