論文の概要: Exploring the Generalization of Cancer Clinical Trial Eligibility Classifiers Across Diseases
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.17135v1
- Date: Mon, 25 Mar 2024 19:17:59 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-27 19:45:52.710992
- Title: Exploring the Generalization of Cancer Clinical Trial Eligibility Classifiers Across Diseases
- Title(参考訳): がん治験適性分類の一般化をめざして
- Authors: Yumeng Yang, Ashley Gilliam, Ethan B Ludmir, Kirk Roberts,
- Abstract要約: 本研究は, 幅広い臨床試験範囲において, 資格分類の一般化可能性を評価することを目的とする。
本研究は,(1)第3相臨床試験,(2)第1相臨床試験,(2)第2相臨床試験,(3)心臓病臨床試験,(4)第2型糖尿病臨床試験,(5)任意の疾患に対する観察試験の5種類の検査基準データをまとめた。
以上の結果から, がんデータセットに基づいてトレーニングしたモデルでは, 自己免疫疾患などの非がん臨床試験で一般的に見られる基準を効果的に扱えることが示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.087385668501741
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Clinical trials are pivotal in medical research, and NLP can enhance their success, with application in recruitment. This study aims to evaluate the generalizability of eligibility classification across a broad spectrum of clinical trials. Starting with phase 3 cancer trials, annotated with seven eligibility exclusions, then to determine how well models can generalize to non-cancer and non-phase 3 trials. To assess this, we have compiled eligibility criteria data for five types of trials: (1) additional phase 3 cancer trials, (2) phase 1 and 2 cancer trials, (3) heart disease trials, (4) type 2 diabetes trials, and (5) observational trials for any disease, comprising 2,490 annotated eligibility criteria across seven exclusion types. Our results show that models trained on the extensive cancer dataset can effectively handle criteria commonly found in non-cancer trials, such as autoimmune diseases. However, they struggle with criteria disproportionately prevalent in cancer trials, like prior malignancy. We also experiment with few-shot learning, demonstrating that a limited number of disease-specific examples can partially overcome this performance gap. We are releasing this new dataset of annotated eligibility statements to promote the development of cross-disease generalization in clinical trial classification.
- Abstract(参考訳): 臨床試験は医学研究において重要であり、NLPは採用に応用してその成功を高めることができる。
本研究は, 幅広い臨床試験範囲において, 資格分類の一般化可能性を評価することを目的とする。
まず第3相臨床試験から始まり、7つのアノテートでアノテートされ、モデルが非がんおよび非フェーズ3臨床試験にどのように一般化できるかを判断する。
これを評価するために,(1)第3相臨床試験,(2)第1相臨床試験,(2)第2相臨床試験,(3)心臓病臨床試験,(4)第2型糖尿病臨床試験,(5)第5相臨床試験の5種類の検査基準データをまとめた。
以上の結果から, がんデータセットに基づいてトレーニングしたモデルでは, 自己免疫疾患などの非がん臨床試験で一般的に見られる基準を効果的に扱えることが示唆された。
しかし、早期悪性腫瘍のように、がんの治験において不適切な基準に苦しむ。
また、このパフォーマンスギャップを部分的に克服できる病気特異的例の数が限られていることを実証して、数発の学習実験を行った。
臨床試験分類におけるクロス・ディスリーズ・ジェネリゼーションの進展を促進するために, 注釈付き適性ステートメントのデータセットを新たにリリースする。
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