論文の概要: Diffusion Methods for Generating Transition Paths
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2309.10276v1
- Date: Tue, 19 Sep 2023 03:03:03 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-09-20 16:34:12.115840
- Title: Diffusion Methods for Generating Transition Paths
- Title(参考訳): 遷移経路生成のための拡散法
- Authors: Luke Triplett and Jianfeng Lu
- Abstract要約: 本研究では,スコアベース生成モデルを用いて準安定状態間の稀な遷移をシミュレートする。
本稿では,チェーンベースアプローチとミッドポイントベースアプローチの2つの新しい経路生成手法を提案する。
M"uller電位とアラニンジペプチドが生成する遷移経路の数値的な結果は、これらのアプローチがデータリッチとデータスカースの両方で有効であることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.222135766747873
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In this work, we seek to simulate rare transitions between metastable states
using score-based generative models. An efficient method for generating
high-quality transition paths is valuable for the study of molecular systems
since data is often difficult to obtain. We develop two novel methods for path
generation in this paper: a chain-based approach and a midpoint-based approach.
The first biases the original dynamics to facilitate transitions, while the
second mirrors splitting techniques and breaks down the original transition
into smaller transitions. Numerical results of generated transition paths for
the M\"uller potential and for Alanine dipeptide demonstrate the effectiveness
of these approaches in both the data-rich and data-scarce regimes.
- Abstract(参考訳): 本研究では,スコアベース生成モデルを用いて準安定状態間の稀な遷移をシミュレートする。
高い品質の遷移経路を生成する効率的な方法は、しばしばデータを得るのが困難であるため、分子システムの研究に有用である。
本稿では,チェーンベースアプローチとミッドポイントベースアプローチの2つの新しい経路生成手法を提案する。
1つ目は遷移を促進するために元のダイナミクスに偏り、もう1つは分割技法を映し出し、元の遷移をより小さな遷移に分解する。
M\"uller電位とアラニンジペプチドの遷移経路の数値的な結果は、これらのアプローチがデータリッチとデータスカースの両方で有効であることを示す。
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