論文の概要: Nuclear Pleomorphism in Canine Cutaneous Mast Cell Tumors: Comparison of Reproducibility and Prognostic Relevance between Estimates, Manual Morphometry and Algorithmic Morphometry
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2309.15031v3
- Date: Thu, 23 May 2024 21:26:31 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-05-27 23:56:12.646549
- Title: Nuclear Pleomorphism in Canine Cutaneous Mast Cell Tumors: Comparison of Reproducibility and Prognostic Relevance between Estimates, Manual Morphometry and Algorithmic Morphometry
- Title(参考訳): 犬皮膚乳腺腫瘍における核多型 : 予後と予後との関連性の比較 : 評価, 手動形態, アルゴリズム形態の比較
- Authors: Andreas Haghofer, Eda Parlak, Alexander Bartel, Taryn A. Donovan, Charles-Antoine Assenmacher, Pompei Bolfa, Michael J. Dark, Andrea Fuchs-Baumgartinger, Andrea Klang, Kathrin Jäger, Robert Klopfleisch, Sophie Merz, Barbara Richter, F. Yvonne Schulman, Hannah Janout, Jonathan Ganz, Josef Scharinger, Marc Aubreville, Stephan M. Winkler, Matti Kiupel, Christof A. Bertram,
- Abstract要約: 核の大きさと形状の変化は多くの腫瘍の悪性度の重要な基準である。
本研究の目的は,犬皮膚マスト細胞腫瘍に対する代替形態計測法を開発することである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 27.096840893847222
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Variation in nuclear size and shape is an important criterion of malignancy for many tumor types; however, categorical estimates by pathologists have poor reproducibility. Measurements of nuclear characteristics (morphometry) can improve reproducibility, but manual methods are time consuming. The aim of this study was to explore the limitations of estimates and develop alternative morphometric solutions for canine cutaneous mast cell tumors (ccMCT). We assessed the following nuclear evaluation methods for measurement accuracy, reproducibility, and prognostic utility: 1) anisokaryosis (karyomegaly) estimates by 11 pathologists; 2) gold standard manual morphometry of at least 100 nuclei; 3) practicable manual morphometry with stratified sampling of 12 nuclei by 9 pathologists; and 4) automated morphometry using a deep learning-based segmentation algorithm. The study dataset comprised 96 ccMCT with available outcome information. The study dataset comprised 96 ccMCT with available outcome information. Inter-rater reproducibility of karyomegaly estimates was low ($\kappa$ = 0.226), while it was good (ICC = 0.654) for practicable morphometry of the standard deviation (SD) of nuclear size. As compared to gold standard manual morphometry (AUC = 0.839, 95% CI: 0.701 - 0.977), the prognostic value (tumor-specific survival) of SDs of nuclear area for practicable manual morphometry (12 nuclei) and automated morphometry were high with an area under the ROC curve (AUC) of 0.868 (95% CI: 0.737 - 0.991) and 0.943 (95% CI: 0.889 - 0.996), respectively. This study supports the use of manual morphometry with stratified sampling of 12 nuclei and algorithmic morphometry to overcome the poor reproducibility of estimates.
- Abstract(参考訳): 核の大きさと形状の変化は多くの腫瘍の悪性度の重要な基準であるが、病理学者による分類学的評価は再現性に乏しい。
核特性の測定(モルフォメトリー)は再現性を向上させるが、手動の手法は時間を要する。
本研究の目的は,犬皮膚マスト細胞腫瘍 (ccMCT) に対する評価限界を調査し, 代替形態計測法を開発することである。
我々は, 測定精度, 再現性, 予測実用性について, 以下の核評価法を評価した。
1) 悪性黒色腫(カリオメガリー)は11名の病理医によって推定される。
2) 少なくとも100個の核の金標準手動形態計測
3)9人の病理医による12個の核の成層サンプリングによる手動形態計測
4)ディープラーニングベースセグメンテーションアルゴリズムを用いて自動形態計測を行った。
研究データセットは96 ccMCTからなり,結果情報が得られた。
研究データセットは96 ccMCTからなり,結果情報が得られた。
核の大きさの標準偏差(SD)の実用可能なモルフォメトリーにはICC = 0.654 が有効であったのに対し、カリオメガリー推定のラター間再現性は低い(\kappa$ = 0.226)。
金標準手形計(AUC = 0.839, 95% CI: 0.701 - 0.977)と比較して、練習可能な手形計(12核)の核領域のSDの予後値(腫瘍特異的生存率)は、それぞれ0.868(95% CI: 0.737 - 0.991)と0.943(95% CI: 0.889 - 0.996)の領域で高い値を示した。
本研究は,12個の原子核を成層的に採取した手動形態計測と,推定の再現性の低さを克服するためのアルゴリズム的形態計測を併用した手動形態計測の活用を支援する。
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