論文の概要: Unraveling Radiomics Complexity: Strategies for Optimal Simplicity in Predictive Modeling
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2407.04888v1
- Date: Fri, 5 Jul 2024 23:14:46 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-07-09 22:07:12.923677
- Title: Unraveling Radiomics Complexity: Strategies for Optimal Simplicity in Predictive Modeling
- Title(参考訳): 放射能の複雑さを解き明かす:予測モデリングにおける最適単純性のための方策
- Authors: Mahdi Ait Lhaj Loutfi, Teodora Boblea Podasca, Alex Zwanenburg, Taman Upadhaya, Jorge Barrios, David R. Raleigh, William C. Chen, Dante P. I. Capaldi, Hong Zheng, Olivier Gevaert, Jing Wu, Alvin C. Silva, Paul J. Zhang, Harrison X. Bai, Jan Seuntjens, Steffen Löck, Patrick O. Richard, Olivier Morin, Caroline Reinhold, Martin Lepage, Martin Vallières,
- Abstract要約: 放射線的特徴セットの高次元性、放射線的特徴タイプの変動性、そして潜在的に高い計算要求は、全て、与えられた臨床問題に対する最小の予測的特徴セットを特定する効果的な方法の必要性を浮き彫りにしている。
我々は,最小限の放射線学的特徴を識別し,説明するための方法論とツールを開発する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.1032659987778315
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Background: The high dimensionality of radiomic feature sets, the variability in radiomic feature types and potentially high computational requirements all underscore the need for an effective method to identify the smallest set of predictive features for a given clinical problem. Purpose: Develop a methodology and tools to identify and explain the smallest set of predictive radiomic features. Materials and Methods: 89,714 radiomic features were extracted from five cancer datasets: low-grade glioma, meningioma, non-small cell lung cancer (NSCLC), and two renal cell carcinoma cohorts (n=2104). Features were categorized by computational complexity into morphological, intensity, texture, linear filters, and nonlinear filters. Models were trained and evaluated on each complexity level using the area under the curve (AUC). The most informative features were identified, and their importance was explained. The optimal complexity level and associated most informative features were identified using systematic statistical significance analyses and a false discovery avoidance procedure, respectively. Their predictive importance was explained using a novel tree-based method. Results: MEDimage, a new open-source tool, was developed to facilitate radiomic studies. Morphological features were optimal for MRI-based meningioma (AUC: 0.65) and low-grade glioma (AUC: 0.68). Intensity features were optimal for CECT-based renal cell carcinoma (AUC: 0.82) and CT-based NSCLC (AUC: 0.76). Texture features were optimal for MRI-based renal cell carcinoma (AUC: 0.72). Tuning the Hounsfield unit range improved results for CECT-based renal cell carcinoma (AUC: 0.86). Conclusion: Our proposed methodology and software can estimate the optimal radiomics complexity level for specific medical outcomes, potentially simplifying the use of radiomics in predictive modeling across various contexts.
- Abstract(参考訳): 背景: 放射線的特徴セットの高次元性, 放射線的特徴タイプの変動性, および潜在的に高い計算要求は, 与えられた臨床問題に対する最小の予測特徴セットを特定する効果的な方法の必要性を浮き彫りにしている。
目的: 最小限の放射能特徴を識別し、説明するための方法論とツールを開発する。
対象と方法:低悪性度グリオーマ,髄膜腫,非小細胞肺癌(NSCLC),腎細胞癌コホート(n=2104。
特徴は計算複雑性によって形態学、強度、テクスチャ、線形フィルタ、非線形フィルタに分類された。
モデルは、曲線(AUC)の下の領域を用いて、各複雑性レベルで訓練され、評価された。
最も重要な特徴が特定され、その重要性が説明された。
組織的統計的意義分析と偽発見回避法を用いて, 最適な複雑性レベルと関連する最も有意な特徴を同定した。
彼らの予測的重要性は、新しい木に基づく手法を用いて説明された。
結果:新しいオープンソースツールであるMEDimageは放射線研究を促進するために開発された。
MRI-based meningioma (AUC: 0.65) およびlow-grade glioma (AUC: 0.68) では形態学的特徴が最適であった。
CECT-based renal cell carcinoma (AUC: 0.82), CT-based NSCLC (AUC: 0.76。
MRIによる腎細胞癌(AUC: 0.72。
CECTによる腎細胞癌(AUC: 0.86。
結論: 提案手法とソフトウェアは, 特定の医学的結果に対して最適な放射能複雑性レベルを推定し, 様々な文脈における予測モデリングにおける放射能の使用を単純化する可能性がある。
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