論文の概要: Mechanical Artifacts in Optical Projection Tomography: Classification
and Automatic Calibration
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2309.16677v1
- Date: Wed, 19 Jul 2023 09:19:40 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-10-23 06:08:56.771580
- Title: Mechanical Artifacts in Optical Projection Tomography: Classification
and Automatic Calibration
- Title(参考訳): 光投影トモグラフィにおけるメカニカルアーティファクト:分類と自動校正
- Authors: Yan Liu, Jonathan Dong, Thanh-An Pham, Francois Marelli and Michael
Unser
- Abstract要約: 光プロジェクショントモグラフィー(OPT)は生体医学研究の強力なツールである。
従来のトモグラフィ再構成アルゴリズムを用いて,高分解能のメソスコピックな生体試料の3次元可視化を実現する。
しかし, 各種の人工物は, 実験装置の欠陥により復元画像の品質を低下させる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 19.98884022478145
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Optical projection tomography (OPT) is a powerful tool for biomedical
studies. It achieves 3D visualization of mesoscopic biological samples with
high spatial resolution using conventional tomographic-reconstruction
algorithms. However, various artifacts degrade the quality of the reconstructed
images due to experimental imperfections in the OPT instruments. While many
efforts have been made to characterize and correct for these artifacts, they
focus on one specific type of artifacts. This work has two contributions.
First, we systematically document a catalog of mechanical artifacts based on a
3D description of the imaging system that uses a set of angular and
translational parameters. Then, we introduce a calibration algorithm that
recovers the unknown system parameters fed into the final 3D iterative
reconstruction algorithm for a distortion-free volumetric image. Simulations
with beads data and experimental results on a fluorescent textile fiber confirm
that our algorithm successfully removes miscalibration artifacts in the
reconstruction.
- Abstract(参考訳): 光プロジェクショントモグラフィー(OPT)は生体医学研究の強力なツールである。
従来のトモグラフィ再構成アルゴリズムを用いて,高分解能のメソスコピック生体試料の3次元可視化を実現する。
しかし, 各種の人工物は, 実験装置の欠陥により復元画像の品質を低下させる。
これらのアーティファクトの特徴と修正に多くの努力がなされているが、彼らは特定の種類のアーティファクトに焦点を当てている。
この作品には2つの貢献がある。
まず, 角度パラメータと翻訳パラメータの組を用いたイメージングシステムの3次元記述に基づいて, メカニカルアーティファクトのカタログを体系的に文書化する。
そして,歪みのない容積画像に対する最終3次元反復再構成アルゴリズムに入力された未知のシステムパラメータを復元するキャリブレーションアルゴリズムを導入する。
ビーズデータを用いたシミュレーションと蛍光繊維繊維の実験結果から,本アルゴリズムが復元時に誤校正物を除去できることが確認された。
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