論文の概要: BTDNet: a Multi-Modal Approach for Brain Tumor Radiogenomic
Classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2310.03485v1
- Date: Thu, 5 Oct 2023 11:56:06 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-10-06 16:24:27.190121
- Title: BTDNet: a Multi-Modal Approach for Brain Tumor Radiogenomic
Classification
- Title(参考訳): BTDNet:脳腫瘍放射線ゲノム分類のためのマルチモーダルアプローチ
- Authors: Dimitrios Kollias, Karanjot Vendal, Priyanka Gadhavi and Solomon
Russom
- Abstract要約: 本稿ではMGMTプロモーターメチル化状態を予測するための新しいマルチモーダルアプローチBTDNetを提案する。
提案手法は, RSNA-ASNR-MICCAI BraTS 2021 Challengeにおける最先端手法よりも優れていた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 14.547418131610188
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Brain tumors pose significant health challenges worldwide, with glioblastoma
being one of the most aggressive forms. Accurate determination of the
O6-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT) promoter methylation status is
crucial for personalized treatment strategies. However, traditional methods are
labor-intensive and time-consuming. This paper proposes a novel multi-modal
approach, BTDNet, leveraging multi-parametric MRI scans, including FLAIR, T1w,
T1wCE, and T2 3D volumes, to predict MGMT promoter methylation status. BTDNet
addresses two main challenges: the variable volume lengths (i.e., each volume
consists of a different number of slices) and the volume-level annotations
(i.e., the whole 3D volume is annotated and not the independent slices that it
consists of). BTDNet consists of four components: i) the data augmentation one
(that performs geometric transformations, convex combinations of data pairs and
test-time data augmentation); ii) the 3D analysis one (that performs global
analysis through a CNN-RNN); iii) the routing one (that contains a mask layer
that handles variable input feature lengths), and iv) the modality fusion one
(that effectively enhances data representation, reduces ambiguities and
mitigates data scarcity). The proposed method outperforms by large margins the
state-of-the-art methods in the RSNA-ASNR-MICCAI BraTS 2021 Challenge, offering
a promising avenue for enhancing brain tumor diagnosis and treatment.
- Abstract(参考訳): 脳腫瘍は世界中で重大な健康上の問題をもたらし、グリオブラスト腫は最も攻撃的な形態の1つである。
o6-メチルグアニン-dnaメチルトランスフェラーゼ(mgmt)プロモーターのメチル化状態の正確な決定は、パーソナライズされた治療戦略に不可欠である。
しかし、伝統的な方法は労働集約的で時間を要する。
本稿では,MTMTプロモーターメチル化状態を予測するために,FLAIR,T1w,T1wCE,T23Dボリュームを含むマルチパラメトリックMRIスキャンを利用する新しいマルチモーダル手法BTDNetを提案する。
BTDNetは、可変ボリューム長(各ボリュームは異なる数のスライスから構成される)とボリュームレベルのアノテーション(つまり、全3Dボリュームは注釈付きで、独立したスライスではない)の2つの主な課題に対処する。
BTDNetは4つのコンポーネントから構成される。
一 データ拡張処理(幾何学的変換、データ対の凸結合及びテスト時データ拡張を行う。)
二 三次元解析装置(CNN-RNNによるグローバル分析を行うもの)
三 ルーティング1(可変入力特徴長を扱うマスク層を含む。)及び
四 モダリティ融合(データ表現を効果的に強化し、あいまいさを低減し、データの不足を緩和する)
提案手法は, rsna-asnr-miccai brats 2021チャレンジの最先端手法を大差で上回り, 脳腫瘍の診断と治療に有望な手段を提供する。
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