論文の概要: Towards equilibrium molecular conformation generation with GFlowNets
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2310.14782v1
- Date: Fri, 20 Oct 2023 15:41:50 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-10-24 20:59:52.839589
- Title: Towards equilibrium molecular conformation generation with GFlowNets
- Title（参考訳）: gflownetsによる平衡分子配座生成に向けて
- Authors: Alexandra Volokhova, Micha{\l} Koziarski, Alex Hern\'andez-Garc\'ia,
Cheng-Hao Liu, Santiago Miret, Pablo Lemos, Luca Thiede, Zichao Yan, Al\'an
Aspuru-Guzik, Yoshua Bengio
- Abstract要約: 我々は,GFlowNetを用いて,分子のエネルギーによって決定されるボルツマン分布から小分子の配座をサンプリングする。
我々はGFlowNetがボルツマン分布に比例して分子ポテンシャルエネルギー表面を再現できることを実証した。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 90.29728873459774
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Sampling diverse, thermodynamically feasible molecular conformations plays a
crucial role in predicting properties of a molecule. In this paper we propose
to use GFlowNet for sampling conformations of small molecules from the
Boltzmann distribution, as determined by the molecule's energy. The proposed
approach can be used in combination with energy estimation methods of different
fidelity and discovers a diverse set of low-energy conformations for highly
flexible drug-like molecules. We demonstrate that GFlowNet can reproduce
molecular potential energy surfaces by sampling proportionally to the Boltzmann
distribution.
- Abstract（参考訳）: 多様な熱力学的に実現可能な分子コンフォメーションのサンプリングは、分子の性質を予測する上で重要な役割を果たす。
本稿では,分子のエネルギーによって決定されるボルツマン分布から小分子のコンフォメーションをサンプリングするためにgflownetを使う方法を提案する。
提案手法は, 異なる忠実度のエネルギー推定法と組み合わせて利用することができ, 高いフレキシブルな薬物様分子に対する低エネルギー配座の多種多様な集合を見出すことができる。
我々はGFlowNetがボルツマン分布に比例して分子ポテンシャルエネルギー表面を再現できることを実証した。
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