論文の概要: Dynamic Neural Fields for Learning Atlases of 4D Fetal MRI Time-series
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.02874v1
- Date: Mon, 6 Nov 2023 05:01:58 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-07 15:26:38.112722
- Title: Dynamic Neural Fields for Learning Atlases of 4D Fetal MRI Time-series
- Title(参考訳): 4次元胎児MRI時系列のアトラス学習のための動的ニューラルネットワーク
- Authors: Zeen Chi, Zhongxiao Cong, Clinton J. Wang, Yingcheng Liu, Esra Abaci
Turk, P. Ellen Grant, S. Mazdak Abulnaga, Polina Golland, Neel Dey
- Abstract要約: 本稿では,ニューラルネットワークを用いた高速バイオメディカル画像アトラス構築法を提案する。
本手法は,子宮における胎児の動的BOLD MRI時系列の被験者別アトラスの学習と運動安定化に応用する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.3611649921759525
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We present a method for fast biomedical image atlas construction using neural
fields. Atlases are key to biomedical image analysis tasks, yet conventional
and deep network estimation methods remain time-intensive. In this preliminary
work, we frame subject-specific atlas building as learning a neural field of
deformable spatiotemporal observations. We apply our method to learning
subject-specific atlases and motion stabilization of dynamic BOLD MRI
time-series of fetuses in utero. Our method yields high-quality atlases of
fetal BOLD time-series with $\sim$5-7$\times$ faster convergence compared to
existing work. While our method slightly underperforms well-tuned baselines in
terms of anatomical overlap, it estimates templates significantly faster, thus
enabling rapid processing and stabilization of large databases of 4D dynamic
MRI acquisitions. Code is available at
https://github.com/Kidrauh/neural-atlasing
- Abstract(参考訳): ニューラルネットワークを用いた高速バイオメディカル画像アトラス構築法を提案する。
アトラスはバイオメディカル画像解析のタスクの鍵であるが、従来のディープネットワーク推定手法は時間集約的のままである。
この予備研究では,変形可能な時空間観測のニューラルフィールドの学習として,主題特異的アトラス構築を構成づける。
本手法は,子宮における胎児の動的BOLD MRI時系列の被験者別アトラス学習と運動安定化に応用する。
本手法は,既存の作業と比較して,$\sim$5-7$\times$高速収束で胎児大胆な時系列の高品質アトラスを生成する。
提案手法は, 解剖学的重複の点において, 高度に調整されたベースラインをわずかに過小評価するが, テンプレートの精度は著しく向上し, 4次元ダイナミックMRIによる大規模データベースの高速処理と安定化が可能となった。
コードはhttps://github.com/Kidrauh/neural-atlasingで入手できる。
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