論文の概要: FetMRQC: a robust quality control system for multi-centric fetal brain MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.04780v2
- Date: Tue, 23 Jul 2024 09:33:23 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-07-24 23:23:10.474854
- Title: FetMRQC: a robust quality control system for multi-centric fetal brain MRI
- Title(参考訳): FetMRQC : 多心性胎児脳MRIのための堅牢な品質制御システム
- Authors: Thomas Sanchez, Oscar Esteban, Yvan Gomez, Alexandre Pron, Mériam Koob, Vincent Dunet, Nadine Girard, Andras Jakab, Elisenda Eixarch, Guillaume Auzias, Meritxell Bach Cuadra,
- Abstract要約: 本稿では,自動画像品質評価と品質管理のためのオープンソースの機械学習フレームワークFetMRQCを提案する。
FetMRQCは、未処理の解剖学的MRIから品質指標のアンサンブルを抽出し、それらを組み合わせて専門家のレーティングを予測する。
我々は、1600以上の胎児脳T2強調画像からなる、先駆的に大きく多様なデータセット上で、我々のフレームワークを検証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 33.08151493899017
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Fetal brain MRI is becoming an increasingly relevant complement to neurosonography for perinatal diagnosis, allowing fundamental insights into fetal brain development throughout gestation. However, uncontrolled fetal motion and heterogeneity in acquisition protocols lead to data of variable quality, potentially biasing the outcome of subsequent studies. We present FetMRQC, an open-source machine-learning framework for automated image quality assessment and quality control that is robust to domain shifts induced by the heterogeneity of clinical data. FetMRQC extracts an ensemble of quality metrics from unprocessed anatomical MRI and combines them to predict experts' ratings using random forests. We validate our framework on a pioneeringly large and diverse dataset of more than 1600 manually rated fetal brain T2-weighted images from four clinical centers and 13 different scanners. Our study shows that FetMRQC's predictions generalize well to unseen data while being interpretable. FetMRQC is a step towards more robust fetal brain neuroimaging, which has the potential to shed new insights on the developing human brain.
- Abstract(参考訳): 胎児脳MRIは、周産期診断のための神経超音波検査の補完となり、妊娠中における胎児脳の発達に関する基本的な洞察を可能にしている。
しかし、摂食プロトコルの制御されていない胎児の動きと不均一性は、変動品質のデータをもたらし、その後の研究の結果をバイアスする可能性がある。
臨床データの異種性によって引き起こされる領域シフトに頑健な画像品質評価と品質管理のためのオープンソースの機械学習フレームワークであるFetMRQCを提案する。
FetMRQCは、未処理の解剖学的MRIから品質指標のアンサンブルを抽出し、それらを組み合わせ、ランダムな森林を用いて専門家のレーティングを予測する。
我々は,4つの臨床センターと13の異なるスキャナーから,1600以上の胎児脳T2強調画像を手作業で評価した,先駆的に大きく多様なデータセット上で,我々の枠組みを検証した。
本研究は,FetMRQCの予測が解釈可能でありながら未確認データによく当てはまることを示す。
FetMRQCは、より堅牢な胎児脳画像へのステップであり、人間の脳の発達に関する新たな洞察を隠蔽する可能性がある。
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