論文の概要: Seeing Beyond Cancer: Multi-Institutional Validation of Object
Localization and 3D Semantic Segmentation using Deep Learning for Breast MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.16213v1
- Date: Mon, 27 Nov 2023 18:22:07 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-29 21:29:34.688153
- Title: Seeing Beyond Cancer: Multi-Institutional Validation of Object
Localization and 3D Semantic Segmentation using Deep Learning for Breast MRI
- Title(参考訳): 癌以外のものを見る: 深層学習による多施設における物体局在の検証と3次元セマンティックセマンティックセグメンテーション
- Authors: Arda Pekis, Vignesh Kannan, Evandros Kaklamanos, Anu Antony, Snehal
Patel, Tyler Earnest
- Abstract要約: そこで本研究では, 乳房内の各組織タイプを正確に分類するために, 組織-組織間相互作用を利用する手法を提案する。
複数の腫瘍周囲組織を統合することで,乳癌のステージング,予後,手術計画に臨床応用が期待できる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The clinical management of breast cancer depends on an accurate understanding
of the tumor and its anatomical context to adjacent tissues and landmark
structures. This context may be provided by semantic segmentation methods;
however, previous works have been largely limited to a singular focus on the
tumor alone and rarely other tissue types. In contrast, we present a method
that exploits tissue-tissue interactions to accurately segment every major
tissue type in the breast including: chest wall, skin, adipose tissue,
fibroglandular tissue, vasculature and tumor via standard-of-care Dynamic
Contrast Enhanced MRI. Comparing our method to prior state-of-the-art, we
achieved a superior Dice score on tumor segmentation while maintaining
competitive performance on other studied tissues across multiple institutions.
Briefly, our method proceeds by localizing the tumor using 2D object detectors,
then segmenting the tumor and surrounding tissues independently using two 3D
U-nets, and finally integrating these results while mitigating false positives
by checking for anatomically plausible tissue-tissue contacts. The object
detection models were pre-trained on ImageNet and COCO, and operated on MIP
(maximum intensity projection) images in the axial and sagittal planes,
establishing a 3D tumor bounding box. By integrating multiple relevant
peri-tumoral tissues, our work enables clinical applications in breast cancer
staging, prognosis and surgical planning.
- Abstract(参考訳): 乳癌の臨床管理は、腫瘍の正確な理解と、隣接する組織やランドマーク構造に対する解剖学的文脈に依存する。
この文脈はセマンティックセグメンテーション法によって提供され得るが、以前の研究は腫瘍のみにのみ焦点をあてることに限られており、他の組織の種類は稀である。
対照的に,胸壁,皮膚,脂肪組織,線維腺組織,血管および腫瘍など,乳房のすべての主要組織タイプを,標準的ダイナミックコントラスト造影MRIで正確に分類するために組織間相互作用を利用する手法を提案する。
本手法を先行技術と比較し,複数の組織にまたがる他の組織との競合性を維持しつつ,腫瘍の分画において優れたdiceスコアを得た。
2Dオブジェクト検出器を用いて腫瘍の局所化を行い、2つの3D U-netを用いて腫瘍とその周辺組織を個別に分画し、最終的には解剖学的に可塑性な組織-組織接触をチェックして偽陽性を緩和する。
物体検出モデルは ImageNet と COCO で事前トレーニングを行い, 軸方向および矢状面のMIP(最大強度投影)画像上で動作し, 3次元の腫瘍境界ボックスを構築した。
複数の腫瘍周囲組織を統合することで,乳癌のステージング,予後,手術計画に臨床応用が期待できる。
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