論文の概要: MedGen: A Python Natural Language Processing Toolkit for Medical Text
Processing
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2311.16588v1
- Date: Tue, 28 Nov 2023 08:13:29 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-11-29 19:21:34.927179
- Title: MedGen: A Python Natural Language Processing Toolkit for Medical Text
Processing
- Title(参考訳): medgen: 医学テキスト処理のためのpython自然言語処理ツールキット
- Authors: Rui Yang, Qingcheng Zeng, Keen You, Yujie Qiao, Lucas Huang, Chia-Chun
Hsieh, Benjamin Rosand, Jeremy Goldwasser, Amisha D Dave, Tiarnan D.L.
Keenan, Emily Y Chew, Dragomir Radev, Zhiyong Lu, Hua Xu, Qingyu Chen, Irene
Li
- Abstract要約: MedGen(メドゲン)は、医学テキスト処理用に設計された総合自然言語処理(NLP)ツールキットである。
初めてMedGenは、質問応答、テキスト要約、テキスト単純化、機械翻訳の4つの高度な生成機能を含んでいる。
MedGenはテキストコーパス上でユーザフレンドリーなクエリと検索機能を提供する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 30.883733024137506
- License: http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
- Abstract: This study introduces MedGen, a comprehensive natural language processing
(NLP) toolkit designed for medical text processing. MedGen is tailored for
biomedical researchers and healthcare professionals with an easy-to-use,
all-in-one solution that requires minimal programming expertise. It includes
(1) Generative Functions: For the first time, MedGen includes four advanced
generative functions: question answering, text summarization, text
simplification, and machine translation; (2) Basic NLP Functions: MedGen
integrates 12 essential NLP functions such as word tokenization and sentence
segmentation; and (3) Query and Search Capabilities: MedGen provides
user-friendly query and search functions on text corpora. We fine-tuned 32
domain-specific language models, evaluated them thoroughly on 24 established
benchmarks and conducted manual reviews with clinicians. Additionally, we
expanded our toolkit by introducing query and search functions, while also
standardizing and integrating functions from third-party libraries. The
toolkit, its models, and associated data are publicly available via
https://github.com/Yale-LILY/MedGen.
- Abstract(参考訳): 本研究は、医学テキスト処理用に設計された包括的自然言語処理(NLP)ツールキットであるMedGenを紹介する。
MedGenは、最小限のプログラミング専門知識を必要とする、使いやすくオールインワンのソリューションを持つバイオメディカル研究者や医療専門家向けにカスタマイズされている。
生成関数: (1)生成関数: 初めて、MedGenは4つの高度な生成関数を含む: 質問応答、テキスト要約、テキスト単純化、機械翻訳、(2)基本NLP関数: MedGenは、単語のトークン化や文のセグメンテーションのような12の必須NLP関数を統合し、(3)クエリと検索機能: MedGenは、テキストコーパス上でユーザフレンドリなクエリと検索機能を提供します。
我々は32のドメイン固有言語モデルを微調整し、24の確立されたベンチマークで徹底的に評価し、臨床医と手動レビューを行った。
さらに,クエリ機能や検索機能を導入してツールキットを拡張し,サードパーティライブラリからの機能を標準化し,統合しました。
ツールキット、そのモデル、および関連するデータはhttps://github.com/Yale-LILY/MedGenから公開されている。
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