論文の概要: A Comprehensive Dataset and Automated Pipeline for Nailfold Capillary Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2312.05930v2
- Date: Thu, 14 Mar 2024 15:39:55 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-16 01:52:29.060593
- Title: A Comprehensive Dataset and Automated Pipeline for Nailfold Capillary Analysis
- Title(参考訳): 爪折り毛細管解析のための包括的データセットと自動パイプライン
- Authors: Linxi Zhao, Jiankai Tang, Dongyu Chen, Xiaohong Liu, Yong Zhou, Yuanchun Shi, Guangyu Wang, Yuntao Wang,
- Abstract要約: 包括的爪折り毛細管データセット-321 画像の構築に先駆的な取り組みを行い,68 名の被験者219 名の動画と臨床報告,専門家注記を行った。
教師付きラベルとして専門家アノテーションを用いた3つのディープラーニングモデルを微調整し、それらを新しいエンドツーエンドの爪折り毛細管分析パイプラインに統合した。
実験の結果, 自動パイプラインでは, 測定値の平均サブピクセルレベルの精度が89.9%, 形態異常が89.9%であった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 24.8934927577986
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Nailfold capillaroscopy is widely used in assessing health conditions, highlighting the pressing need for an automated nailfold capillary analysis system. In this study, we present a pioneering effort in constructing a comprehensive nailfold capillary dataset-321 images, 219 videos from 68 subjects, with clinic reports and expert annotations-that serves as a crucial resource for training deep-learning models. Leveraging this dataset, we finetuned three deep learning models with expert annotations as supervised labels and integrated them into a novel end-to-end nailfold capillary analysis pipeline. This pipeline excels in automatically detecting and measuring a wide range of size factors, morphological features, and dynamic aspects of nailfold capillaries. We compared our outcomes with clinical reports. Experiment results showed that our automated pipeline achieves an average of sub-pixel level precision in measurements and 89.9% accuracy in identifying morphological abnormalities. These results underscore its potential for advancing quantitative medical research and enabling pervasive computing in healthcare. Our data and code are available at https://github.com/THU-CS-PI-LAB/ANFC-Automated-Nailfold-Capillary.
- Abstract(参考訳): ネイルフォールドカピラロスコープは、自動的にネイルフォールドキャピラリー分析システムの必要性を強調し、健康状態を評価するために広く用いられている。
本研究では,68名を対象に,包括的ネイルフォールド・キャピラリー・データセット321画像,219件のビデオ,臨床報告,専門家注記などを構築し,深層学習モデルの訓練に欠かせない資料を提供する。
このデータセットを活用して、専門家アノテーションを教師付きラベルとして3つのディープラーニングモデルを微調整し、それらを新しいエンドツーエンドのネイルフォールドキャピラリー分析パイプラインに統合しました。
このパイプラインは、爪折りキャピラリーの幅広いサイズ要因、形態的特徴、動的側面を自動的に検出し、測定する。
結果と臨床報告を比較した。
実験の結果, 自動パイプラインでは, 測定値の平均サブピクセルレベルの精度が89.9%, 形態異常が89.9%であった。
これらの結果は、定量的医学研究の進展と、医療における広汎なコンピューティングの実現の可能性を浮き彫りにしている。
私たちのデータとコードはhttps://github.com/THU-CS-PI-LAB/ANFC-Automated-Nailfold-Capillaryで公開されています。
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