論文の概要: Temporal Supervised Contrastive Learning for Modeling Patient Risk
Progression
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2312.05933v1
- Date: Sun, 10 Dec 2023 16:43:15 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-12-12 17:49:44.296648
- Title: Temporal Supervised Contrastive Learning for Modeling Patient Risk
Progression
- Title(参考訳): 患者リスク進行のモデル化のための時間監督型コントラスト学習
- Authors: Shahriar Noroozizadeh, Jeremy C. Weiss, George H. Chen
- Abstract要約: 本稿では,患者時系列の各段階の埋め込み表現を学習する教師付きコントラスト学習フレームワークを提案する。
組込み空間の近傍点は類似した予測クラス確率を持ち,(2)組込み空間の近傍点に同じ時系列マップの隣接時間ステップ,(3)組込み空間の遠く離れた領域に全く異なる原特徴ベクトルを持つ時間ステップを持つ。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.185263022907744
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We consider the problem of predicting how the likelihood of an outcome of
interest for a patient changes over time as we observe more of the patient
data. To solve this problem, we propose a supervised contrastive learning
framework that learns an embedding representation for each time step of a
patient time series. Our framework learns the embedding space to have the
following properties: (1) nearby points in the embedding space have similar
predicted class probabilities, (2) adjacent time steps of the same time series
map to nearby points in the embedding space, and (3) time steps with very
different raw feature vectors map to far apart regions of the embedding space.
To achieve property (3), we employ a nearest neighbor pairing mechanism in the
raw feature space. This mechanism also serves as an alternative to data
augmentation, a key ingredient of contrastive learning, which lacks a standard
procedure that is adequately realistic for clinical tabular data, to our
knowledge. We demonstrate that our approach outperforms state-of-the-art
baselines in predicting mortality of septic patients (MIMIC-III dataset) and
tracking progression of cognitive impairment (ADNI dataset). Our method also
consistently recovers the correct synthetic dataset embedding structure across
experiments, a feat not achieved by baselines. Our ablation experiments show
the pivotal role of our nearest neighbor pairing.
- Abstract(参考訳): 我々は,患者の興味ある結果の可能性が,患者のデータより多く観察されるにつれてどのように変化するかを予測する問題を考える。
この問題を解決するために,患者時系列の各段階の埋め込み表現を学習する教師付きコントラスト学習フレームワークを提案する。
組込み空間は,(1)組込み空間内の近傍点が類似するクラス確率を持つ,(2)組込み空間内の近傍点に対する同一時系列マップの隣接時間ステップ,(3)全く異なる生特徴ベクトルを持つ時間ステップが組込み空間の遠く離れた領域にマップされる,という特性を持つように学習する。
特性 (3) を達成するために, 原特徴空間に最も近い近傍のペアリング機構を用いる。
このメカニズムは、臨床表形式データに対して適切な現実性を持つ標準的手順を欠いているコントラスト学習の重要な要素であるデータ拡張の代替としても機能する。
本手法は, 敗血症患者 (MIMIC-III データセット) の死亡を予測し, 認知障害者 (ADNI データセット) の進行の追跡において, 最先端のベースラインよりも優れていることを示す。
また,本手法は,実験全体にわたる正しい合成データセットの埋め込み構造を一貫して復元する。
我々のアブレーション実験は、最も近い隣人のペアリングの重要な役割を示している。
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