論文の概要: FSscore: A Machine Learning-based Synthetic Feasibility Score Leveraging Human Expertise
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2312.12737v2
- Date: Sat, 05 Oct 2024 13:14:14 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-10-08 13:09:36.256629
- Title: FSscore: A Machine Learning-based Synthetic Feasibility Score Leveraging Human Expertise
- Title(参考訳): FSscore: 人間の専門知識を活用する機械学習ベースの合成可能性スコア
- Authors: Rebecca M. Neeser, Bruno Correia, Philippe Schwaller,
- Abstract要約: この研究は、機械学習を用いて相対的な合成容易性に基づいて構造をランク付けするFocused Synthesizability score(FSscore)を導入している。
FSscoreは、様々な化学応用のための合成実現可能性の評価を最適化するために、どのようにしてヒト・イン・ザ・ループ・フレームワークを利用できるかを示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.7045000393120925
- License:
- Abstract: Determining whether a molecule can be synthesized is crucial in chemistry and drug discovery, as it guides experimental prioritization and molecule ranking in de novo design tasks. Existing scoring approaches to assess synthetic feasibility struggle to extrapolate to new chemical spaces or fail to discriminate based on subtle differences such as chirality. This work addresses these limitations by introducing the Focused Synthesizability score~(FSscore), which uses machine learning to rank structures based on their relative ease of synthesis. First, a baseline trained on an extensive set of reactant-product pairs is established, which is then refined with expert human feedback tailored to specific chemical spaces. This targeted fine-tuning improves performance on these chemical scopes, enabling more accurate differentiation between molecules that are hard and easy to synthesize. The FSscore showcases how a human-in-the-loop framework can be utilized to optimize the assessment of synthetic feasibility for various chemical applications.
- Abstract(参考訳): 分子が合成できるかどうかを決定することは化学的および薬物発見に不可欠であり、デ・ノボの設計タスクにおいて実験的な優先順位付けと分子ランク付けを導く。
既存のスコアリング手法は、新しい化学空間への外挿や、キラリティーのような微妙な相違に基づく識別に失敗するために合成可能性の評価に苦労している。
この研究は、機械学習を用いて相対的な合成の容易さに基づいて構造をランク付けするFocused Synthesizability score~(FSscore)を導入することで、これらの制限に対処する。
まず、幅広い反応物と生成物のペアで訓練されたベースラインが確立され、その後、特定の化学空間に合わせた専門家のフィードバックで洗練される。
この微調整により、これらの化学スコープの性能が向上し、合成が困難で容易な分子間のより正確な分化が可能になる。
FSscoreは、様々な化学応用のための合成実現可能性の評価を最適化するために、どのようにしてヒト・イン・ザ・ループ・フレームワークを利用できるかを示した。
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