論文の概要: SPEER: Sentence-Level Planning of Long Clinical Summaries via Embedded
Entity Retrieval
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2401.02369v1
- Date: Thu, 4 Jan 2024 17:23:44 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-01-05 14:34:53.748173
- Title: SPEER: Sentence-Level Planning of Long Clinical Summaries via Embedded
Entity Retrieval
- Title(参考訳): SPEER:組込みエンティティ検索による長期臨床医の文レベルプランニング
- Authors: Griffin Adams, Jason Zucker, No\'emie Elhadad
- Abstract要約: 臨床医は、患者が退院するたびに、長い要約を書かなければならない。
要約が臨床的に有用であるためには、健全な実体を同定し、カバーすることが不可欠である。
我々は、そのタスクでオープンソースLLMを微調整し、不完全で不誠実な要約を生成することを発見した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.669063174637433
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Clinician must write a lengthy summary each time a patient is discharged from
the hospital. This task is time-consuming due to the sheer number of unique
clinical concepts covered in the admission. Identifying and covering salient
entities is vital for the summary to be clinically useful. We fine-tune
open-source LLMs (Mistral-7B-Instruct and Zephyr-7B-\b{eta}) on the task and
find that they generate incomplete and unfaithful summaries. To increase entity
coverage, we train a smaller, encoder-only model to predict salient entities,
which are treated as content-plans to guide the LLM. To encourage the LLM to
focus on specific mentions in the source notes, we propose SPEER:
Sentence-level Planning via Embedded Entity Retrieval. Specifically, we mark
each salient entity span with special "{{ }}" boundary tags and instruct the
LLM to retrieve marked spans before generating each sentence. Sentence-level
planning acts as a form of state tracking in that the model is explicitly
recording the entities it uses. We fine-tune Mistral and Zephyr variants on a
large-scale, diverse dataset of ~167k in-patient hospital admissions and
evaluate on 3 datasets. SPEER shows gains in both coverage and faithfulness
metrics over non-guided and guided baselines.
- Abstract(参考訳): 臨床医は、患者が退院するたびに、長い要約を書かなければならない。
このタスクは、入院時にカバーされるユニークな臨床概念の数が多いため、時間がかかります。
要約が臨床的に有用であるためには、健全な実体の同定と被覆が不可欠である。
我々は、そのタスクにオープンソース LLM (Mistral-7B-Instruct および Zephyr-7B-\b{eta}) を微調整し、不完全かつ不誠実な要約を生成する。
エンティティのカバレッジを高めるために,LLMをガイドするコンテンツプランとして扱われる有能なエンティティを予測するために,より小さなエンコーダのみのモデルを訓練する。
LLMがソースノートの特定の言及に集中するように促すため、SPEER: Embedded Entity Retrievalによる文レベルのプランニングを提案します。
具体的には、それぞれの有意なエンティティに特別な"{{ }}"境界タグを付けてマークし、各文を生成する前にLLMにマークされたスパンを検索するように指示する。
文レベルのプランニングは、モデルが使用するエンティティを明示的に記録している状態追跡の形式として機能する。
入院患者約167kの大規模多種多様なデータセット上でミストラルとゼファーの変異を微調整し,3つのデータセットを評価した。
SPEERは、非ガイドベースラインやガイドベースラインよりも、カバレッジと忠実度の両方が向上していることを示している。
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