論文の概要: Assessing the Extrapolation Capability of Template-Free Retrosynthesis
Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.03960v1
- Date: Thu, 29 Feb 2024 00:48:17 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-10 23:52:56.379402
- Title: Assessing the Extrapolation Capability of Template-Free Retrosynthesis
Models
- Title(参考訳): テンプレートフリー・レトロシンセシスモデルの補間能力評価
- Authors: Shuan Chen and Yousung Jung
- Abstract要約: 本研究では, 最先端のテンプレートフリーモデルの外挿能力を実験的に評価し, 広範囲なオフ・オブ・ディストリビューション(OOD)反応を巧みに組み立てた。
その結果, テンプレートフリーモデルでは新しい規則による合成を予測できるが, OOD反応におけるトップ10の精度は著しく低調であることがわかった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.7770029179741429
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Despite the acknowledged capability of template-free models in exploring
unseen reaction spaces compared to template-based models for retrosynthesis
prediction, their ability to venture beyond established boundaries remains
relatively uncharted. In this study, we empirically assess the extrapolation
capability of state-of-the-art template-free models by meticulously assembling
an extensive set of out-of-distribution (OOD) reactions. Our findings
demonstrate that while template-free models exhibit potential in predicting
precursors with novel synthesis rules, their top-10 exact-match accuracy in OOD
reactions is strikingly modest (< 1%). Furthermore, despite the capability of
generating novel reactions, our investigation highlights a recurring issue
where more than half of the novel reactions predicted by template-free models
are chemically implausible. Consequently, we advocate for the future
development of template-free models that integrate considerations of chemical
feasibility when navigating unexplored regions of reaction space.
- Abstract(参考訳): テンプレートのない反応空間を探索する能力はレトロシンセシス予測のテンプレートベースのモデルに比べて認められているものの、確立された境界を超えて活動する能力は、比較的未獲得のままである。
本研究では,ood(out-of-distribution)反応の広範な集合を細心の注意を払って組み立てることで,最先端テンプレートフリーモデルの補間能力を実験的に評価した。
以上の結果から,新しい合成規則によりテンプレートフリーモデルが前駆体を予測できる可能性が示されたが,ood反応におけるtop-10の正確なマッチング精度は極めて低い(<1%)。
さらに, 新規反応生成の可能性にも拘わらず, テンプレートフリーモデルによって予測される新規反応の半分以上は化学的に予測できないという繰り返し問題に注目する。
その結果,反応空間の未探索領域をナビゲートする際の化学的実現可能性を考慮したテンプレートフリーモデルの開発が期待できる。
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