論文の概要: RetroComposer: Discovering Novel Reactions by Composing Templates for
Retrosynthesis Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2112.11225v1
- Date: Mon, 20 Dec 2021 05:57:07 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-12-23 02:12:37.888449
- Title: RetroComposer: Discovering Novel Reactions by Composing Templates for
Retrosynthesis Prediction
- Title(参考訳): RetroComposer: 再合成予測のためのテンプレートによる新しい反応の発見
- Authors: Chaochao Yan, Peilin Zhao, Chan Lu, Yang Yu, Junzhou Huang
- Abstract要約: 本稿では,テンプレート以外の新しいテンプレートを構築可能な,革新的な再合成予測フレームワークを提案する。
実験結果から,USPTO-50Kデータセットにおいて,328個のテスト反応のためのテンプレートを新たに作成できることが示唆された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 63.14937611038264
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The main target of retrosynthesis is to recursively decompose desired
molecules into available building blocks. Existing template-based
retrosynthesis methods follow a template selection stereotype and suffer from
the limited training templates, which prevents them from discovering novel
reactions. To overcome the limitation, we propose an innovative retrosynthesis
prediction framework that can compose novel templates beyond training
templates. So far as we know, this is the first method that can find novel
templates for retrosynthesis prediction. Besides, we propose an effective
reactant candidates scoring model that can capture atom-level transformation
information, and it helps our method outperform existing methods by a large
margin. Experimental results show that our method can produce novel templates
for 328 test reactions in the USPTO-50K dataset, including 21 test reactions
that are not covered by the training templates.
- Abstract(参考訳): レトロ合成の主目的は、所望の分子を利用可能な構成要素に再帰的に分解することである。
既存のテンプレートベースの逆合成法は、テンプレート選択ステレオタイプに従い、限られたトレーニングテンプレートに悩まされ、新しい反応を発見するのを妨げている。
この限界を克服するため,我々は,新しいテンプレートを訓練テンプレートを超えて構成できる,革新的なレトロシンセシス予測フレームワークを提案する。
われわれが知る限りでは、これはレトロシンセシス予測のための新しいテンプレートを見つける最初の方法である。
さらに,原子レベルの変換情報をキャプチャ可能な効果的な反応候補スコアリングモデルを提案する。
実験結果から,USPTO-50Kデータセットでは,トレーニングテンプレートでカバーされていない21の試験反応を含む328の試験反応に対して,新しいテンプレートを作成できることが示唆された。
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