論文の概要: ReStainGAN: Leveraging IHC to IF Stain Domain Translation for in-silico
Data Generation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.06545v1
- Date: Mon, 11 Mar 2024 09:45:34 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-12 19:44:13.117306
- Title: ReStainGAN: Leveraging IHC to IF Stain Domain Translation for in-silico
Data Generation
- Title(参考訳): ReStainGAN: IHC をIF ドメイン変換に活用したインサイリコデータ生成
- Authors: Dominik Winter, Nicolas Triltsch, Philipp Plewa, Marco Rosati, Thomas
Padel, Ross Hill, Markus Schick, Nicolas Brieu
- Abstract要約: In-silicoデータセットは、計算病理学において異なる染色パターンを持つ新しいドメインに既存のアノテーションの有用性を拡張することができる。
免疫蛍光 (IF) 画像において, 形態特異的なIHC染色を別の画像チャネルに切り離し, シリカ化学(IHC) 画像を生成するための新しい手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.12564343689544843
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: The creation of in-silico datasets can expand the utility of existing
annotations to new domains with different staining patterns in computational
pathology. As such, it has the potential to significantly lower the cost
associated with building large and pixel precise datasets needed to train
supervised deep learning models. We propose a novel approach for the generation
of in-silico immunohistochemistry (IHC) images by disentangling morphology
specific IHC stains into separate image channels in immunofluorescence (IF)
images. The proposed approach qualitatively and quantitatively outperforms
baseline methods as proven by training nucleus segmentation models on the
created in-silico datasets.
- Abstract(参考訳): in-silicoデータセットの作成は、計算病理学において異なる染色パターンを持つ新しいドメインに既存のアノテーションの有用性を広げることができる。
そのため、教師付きディープラーニングモデルをトレーニングするために必要な、大規模かつピクセルの正確なデータセットの構築に関連するコストを大幅に削減する可能性がある。
免疫蛍光 (IF) 画像において, 形態特異的なIHC染色を別の画像チャネルに切り離して, シリカ内免疫組織化学(IHC)画像を生成する新しい手法を提案する。
提案手法は,生成したin-silicoデータセット上での核セグメンテーションモデルのトレーニングによって証明されたベースライン手法を質的かつ定量的に上回る。
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