論文の概要: Circle Representation for Medical Instance Object Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.11507v1
- Date: Mon, 18 Mar 2024 06:25:41 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-19 16:26:41.703872
- Title: Circle Representation for Medical Instance Object Segmentation
- Title(参考訳): 医療用インスタンスオブジェクトセグメンテーションのためのサークル表現
- Authors: Juming Xiong, Ethan H. Nguyen, Yilin Liu, Ruining Deng, Regina N Tyree, Hernan Correa, Girish Hiremath, Yaohong Wang, Haichun Yang, Agnes B. Fogo, Yuankai Huo,
- Abstract要約: 球状医療オブジェクトをインスタンスレベルでセグメント化するための円輪郭変形を利用した,単純なエンドツーエンドセグメンテーション手法であるCircleSnakeを紹介する。
病理画像における糸球体、核、好酸球の検出などの実用化において、CircleSnakeは優れた性能と回転不変性を示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.4832235108711345
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Recently, circle representation has been introduced for medical imaging, designed specifically to enhance the detection of instance objects that are spherically shaped (e.g., cells, glomeruli, and nuclei). Given its outstanding effectiveness in instance detection, it is compelling to consider the application of circle representation for segmenting instance medical objects. In this study, we introduce CircleSnake, a simple end-to-end segmentation approach that utilizes circle contour deformation for segmenting ball-shaped medical objects at the instance level. The innovation of CircleSnake lies in these three areas: (1) It substitutes the complex bounding box-to-octagon contour transformation with a more consistent and rotation-invariant bounding circle-to-circle contour adaptation. This adaptation specifically targets ball-shaped medical objects. (2) The circle representation employed in CircleSnake significantly reduces the degrees of freedom to two, compared to eight in the octagon representation. This reduction enhances both the robustness of the segmentation performance and the rotational consistency of the method. (3) CircleSnake is the first end-to-end deep instance segmentation pipeline to incorporate circle representation, encompassing consistent circle detection, circle contour proposal, and circular convolution in a unified framework. This integration is achieved through the novel application of circular graph convolution within the context of circle detection and instance segmentation. In practical applications, such as the detection of glomeruli, nuclei, and eosinophils in pathological images, CircleSnake has demonstrated superior performance and greater rotation invariance when compared to benchmarks. The code has been made publicly available: https://github.com/hrlblab/CircleSnake.
- Abstract(参考訳): 近年、球形(例えば、細胞、糸球体、核など)のインスタンスオブジェクトの検出を強化するためにデザインされた医療画像のための円表現が導入されている。
インスタンス検出における顕著な有効性を考えると、円表現の例医療オブジェクトのセグメント化への応用を考えることは魅力的である。
本研究では,球状医療オブジェクトをインスタンスレベルでセグメント化するための円輪郭変形を利用した,単純なエンドツーエンドセグメンテーション手法であるCircleSnakeを紹介する。
CircleSnakeの革新は以下の3つの領域にある: 1) 複素有界箱対八角形の輪郭変換を、より一貫した、回転不変な円対円の輪郭適応で置き換える。
この適応は、特にボール型の医療オブジェクトをターゲットにしている。
2)CircleSnakeにおける円表現は,八角形表現では八角形表現では八角形表現の場合に比べて,自由度を2に著しく低下させる。
この低減により, セグメンテーション性能の堅牢性と手法の回転整合性の両方が向上する。
(3)CircleSnakeは、円の表現を取り入れた最初のエンドツーエンドのディープ・インスタンス・セグメンテーションパイプラインであり、一貫した円の検出、円の輪郭の提案、および円の畳み込みを統一されたフレームワークに含めている。
この積分は、円検出とインスタンスセグメンテーションの文脈における円グラフ畳み込みの新たな応用によって達成される。
病理画像における糸球体、核、好酸球の検出などの実用的応用において、CircleSnakeはベンチマークと比較して優れた性能と回転不変性を示した。
コードは、https://github.com/hrlblab/CircleSnake.comで公開されている。
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