論文の概要: Debiasing Cardiac Imaging with Controlled Latent Diffusion Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.19508v1
- Date: Thu, 28 Mar 2024 15:41:43 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-03-29 15:44:37.901990
- Title: Debiasing Cardiac Imaging with Controlled Latent Diffusion Models
- Title(参考訳): 遅延拡散モデルを用いた除細動心イメージング
- Authors: Grzegorz Skorupko, Richard Osuala, Zuzanna Szafranowska, Kaisar Kushibar, Nay Aung, Steffen E Petersen, Karim Lekadir, Polyxeni Gkontra,
- Abstract要約: 本稿では,データセットに固有の不均衡を,合成データの生成によって緩和する手法を提案する。
我々は,患者メタデータと心臓の形状から合成したテキストを条件に,拡散確率モデルに基づく制御ネットを採用する。
本実験は,データセットの不均衡を緩和する手法の有効性を実証するものである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.802269171647208
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The progress in deep learning solutions for disease diagnosis and prognosis based on cardiac magnetic resonance imaging is hindered by highly imbalanced and biased training data. To address this issue, we propose a method to alleviate imbalances inherent in datasets through the generation of synthetic data based on sensitive attributes such as sex, age, body mass index, and health condition. We adopt ControlNet based on a denoising diffusion probabilistic model to condition on text assembled from patient metadata and cardiac geometry derived from segmentation masks using a large-cohort study, specifically, the UK Biobank. We assess our method by evaluating the realism of the generated images using established quantitative metrics. Furthermore, we conduct a downstream classification task aimed at debiasing a classifier by rectifying imbalances within underrepresented groups through synthetically generated samples. Our experiments demonstrate the effectiveness of the proposed approach in mitigating dataset imbalances, such as the scarcity of younger patients or individuals with normal BMI level suffering from heart failure. This work represents a major step towards the adoption of synthetic data for the development of fair and generalizable models for medical classification tasks. Notably, we conduct all our experiments using a single, consumer-level GPU to highlight the feasibility of our approach within resource-constrained environments. Our code is available at https://github.com/faildeny/debiasing-cardiac-mri.
- Abstract(参考訳): 心磁気共鳴画像による疾患診断と予後の深層学習ソリューションの進歩は、高度に不均衡で偏りのあるトレーニングデータによって妨げられる。
この問題に対処するため,性別,年齢,体重指数,健康状態などのセンシティブな属性に基づいて合成データを生成することにより,データセット固有の不均衡を緩和する手法を提案する。
我々は,患者メタデータとセグメンテーションマスクから得られた心臓形状から作成したテキストに対して,大規模なコホート研究,特に英国バイオバンクを条件として,拡散確率モデルに基づく制御ネットを採用する。
提案手法は,確立した定量的指標を用いて生成した画像のリアリズムを評価することで評価する。
さらに, 合成標本を用いて, 下位表現群内の不均衡を補正することにより, 分類器のデバイアス化を目的とした下流分類作業を行う。
本研究は,若年者や正常BMI患者の心不全等のデータセット不均衡を緩和する手法の有効性を実証するものである。
この研究は、医学分類タスクのための公正で一般化可能なモデル開発のための合成データの導入に向けた大きな一歩である。
特に、リソース制約のある環境におけるアプローチの実現可能性を強調するために、1つのコンシューマレベルのGPUを使用して、すべての実験を行います。
私たちのコードはhttps://github.com/faildeny/debiasing-cardiac-mri.comで公開されています。
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