論文の概要: MedCLIP-SAM: Bridging Text and Image Towards Universal Medical Image Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2403.20253v2
- Date: Wed, 19 Jun 2024 16:21:34 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-06-22 04:30:07.839540
- Title: MedCLIP-SAM: Bridging Text and Image Towards Universal Medical Image Segmentation
- Title(参考訳): MedCLIP-SAM:Universal Medical Image Segmentationに向けたテキストと画像のブリッジ
- Authors: Taha Koleilat, Hojat Asgariandehkordi, Hassan Rivaz, Yiming Xiao,
- Abstract要約: 本稿では,CLIPモデルとSAMモデルを組み合わせて臨床スキャンのセグメンテーションを生成する新しいフレームワーク MedCLIP-SAM を提案する。
3つの多様なセグメンテーションタスクと医用画像モダリティを広範囲にテストすることにより、提案手法は優れた精度を示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.2585213273821716
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Medical image segmentation of anatomical structures and pathology is crucial in modern clinical diagnosis, disease study, and treatment planning. To date, great progress has been made in deep learning-based segmentation techniques, but most methods still lack data efficiency, generalizability, and interactability. Consequently, the development of new, precise segmentation methods that demand fewer labeled datasets is of utmost importance in medical image analysis. Recently, the emergence of foundation models, such as CLIP and Segment-Anything-Model (SAM), with comprehensive cross-domain representation opened the door for interactive and universal image segmentation. However, exploration of these models for data-efficient medical image segmentation is still limited, but is highly necessary. In this paper, we propose a novel framework, called MedCLIP-SAM that combines CLIP and SAM models to generate segmentation of clinical scans using text prompts in both zero-shot and weakly supervised settings. To achieve this, we employed a new Decoupled Hard Negative Noise Contrastive Estimation (DHN-NCE) loss to fine-tune the BiomedCLIP model and the recent gScoreCAM to generate prompts to obtain segmentation masks from SAM in a zero-shot setting. Additionally, we explored the use of zero-shot segmentation labels in a weakly supervised paradigm to improve the segmentation quality further. By extensively testing three diverse segmentation tasks and medical image modalities (breast tumor ultrasound, brain tumor MRI, and lung X-ray), our proposed framework has demonstrated excellent accuracy. Code is available at https://github.com/HealthX-Lab/MedCLIP-SAM.
- Abstract(参考訳): 解剖学的構造と病理の医学的イメージセグメンテーションは、現代の臨床診断、疾患研究、治療計画において重要である。
これまで、ディープラーニングベースのセグメンテーション技術は大きな進歩を遂げてきたが、ほとんどの手法はデータ効率、一般化可能性、相互作用性に欠けていた。
したがって、ラベル付きデータセットの少ない新しい正確なセグメンテーション手法の開発は、医療画像解析において非常に重要である。
近年、CLIPやSAM(Segment-Anything-Model)などの基盤モデルが出現し、包括的なクロスドメイン表現が登場し、インタラクティブで普遍的なイメージセグメンテーションの扉が開かれた。
しかし、これらのデータ効率の良い医用画像分割のためのモデル探索は依然として限られているが、非常に必要である。
本稿では,CLIPモデルとSAMモデルを組み合わせて,ゼロショットと弱教師付き設定の両方でテキストプロンプトを用いて臨床スキャンのセグメンテーションを生成する,MedCLIP-SAMという新しいフレームワークを提案する。
そこで我々は,BiomedCLIPモデルと最新のgScoreCAMを微調整するためにDHN-NCE(Decoupled Hard Negative Noise Contrastive Estimation)を新たに導入し,ゼロショット設定でSAMからセグメンテーションマスクを得るプロンプトを生成する。
さらに,ゼロショットセグメンテーションラベルを弱教師付きパラダイムで使用して,セグメンテーションの品質をさらに向上する方法について検討した。
胸部超音波検査,脳腫瘍MRI検査,肺X線検査の3つのタスクと医用画像モダリティを広範囲にテストすることにより,提案手法の精度が向上した。
コードはhttps://github.com/HealthX-Lab/MedCLIP-SAMで入手できる。
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