論文の概要: Test-Time Adaptation with SaLIP: A Cascade of SAM and CLIP for Zero shot Medical Image Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2404.06362v2
- Date: Tue, 30 Apr 2024 15:58:32 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-05-01 18:49:14.899527
- Title: Test-Time Adaptation with SaLIP: A Cascade of SAM and CLIP for Zero shot Medical Image Segmentation
- Title(参考訳): SaLIPによるテスト時間適応:ゼロショット医用画像分割のためのSAMとCLIPのケース
- Authors: Sidra Aleem, Fangyijie Wang, Mayug Maniparambil, Eric Arazo, Julia Dietlmeier, Guenole Silvestre, Kathleen Curran, Noel E. O'Connor, Suzanne Little,
- Abstract要約: 臓器分割のための単純な統合フレームワークSaLIPを提案する。
SAMは画像内の部分ベースのセグメンテーションに使用され、CLIPは関心領域に対応するマスクを検索する。
最後に、SAMは検索されたROIによって特定の臓器を分節するように促される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 10.444726122035133
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The Segment Anything Model (SAM) and CLIP are remarkable vision foundation models (VFMs). SAM, a prompt driven segmentation model, excels in segmentation tasks across diverse domains, while CLIP is renowned for its zero shot recognition capabilities. However, their unified potential has not yet been explored in medical image segmentation. To adapt SAM to medical imaging, existing methods primarily rely on tuning strategies that require extensive data or prior prompts tailored to the specific task, making it particularly challenging when only a limited number of data samples are available. This work presents an in depth exploration of integrating SAM and CLIP into a unified framework for medical image segmentation. Specifically, we propose a simple unified framework, SaLIP, for organ segmentation. Initially, SAM is used for part based segmentation within the image, followed by CLIP to retrieve the mask corresponding to the region of interest (ROI) from the pool of SAM generated masks. Finally, SAM is prompted by the retrieved ROI to segment a specific organ. Thus, SaLIP is training and fine tuning free and does not rely on domain expertise or labeled data for prompt engineering. Our method shows substantial enhancements in zero shot segmentation, showcasing notable improvements in DICE scores across diverse segmentation tasks like brain (63.46%), lung (50.11%), and fetal head (30.82%), when compared to un prompted SAM. Code and text prompts are available at: https://github.com/aleemsidra/SaLIP.
- Abstract(参考訳): Segment Anything Model (SAM) と CLIP は目覚しいビジョン基盤モデル (VFM) である。
プロンプト駆動セグメンテーションモデルであるSAMは、さまざまなドメインにわたるセグメンテーションタスクを優れており、CLIPはそのゼロショット認識機能で有名である。
しかし, 医用画像のセグメンテーションにおいて, 統一された可能性はまだ検討されていない。
SAMを医用画像に適応させるためには、既存の手法は主に、広範囲なデータや特定のタスクに合わせた事前プロンプトを必要とするチューニング戦略に依存しており、限られたデータサンプルしか利用できない場合には特に困難である。
本研究は、SAMとCLIPを医用画像セグメンテーションの統一フレームワークに統合するための深層探査である。
具体的には,臓器分割のための単純な統合フレームワークSaLIPを提案する。
SAMは画像内の部分ベースのセグメンテーションに使用され、CLIPはSAM生成マスクのプールから関心領域(ROI)に対応するマスクを検索する。
最後に、SAMは検索されたROIによって特定の臓器を分節するように促される。
従って、SaLIPはトレーニングと微調整を無償で行い、ドメインの専門知識やラベル付きデータに即時エンジニアリングを頼らない。
提案法は, ゼロショットセグメンテーションにおいて顕著な改善を示し, 脳(63.46%), 肺(50.11%), 胎児頭(30.82%)におけるDICEスコアの顕著な改善を示した。
コードとテキストのプロンプトは、https://github.com/aleemsidra/SaLIP.comで入手できる。
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