論文の概要: Learning Chemotherapy Drug Action via Universal Physics-Informed Neural Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2404.08019v1
- Date: Thu, 11 Apr 2024 01:30:05 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-04-15 16:44:18.115740
- Title: Learning Chemotherapy Drug Action via Universal Physics-Informed Neural Networks
- Title(参考訳): ユニバーサル物理インフォームドニューラルネットワークによる薬物療法の学習
- Authors: Lena Podina, Ali Ghodsi, Mohammad Kohandel,
- Abstract要約: 様々な微分方程式の未知成分を学習するためにユニバーサル物理情報ニューラルネットワークを適用する。
合成データから3つの一般的な薬剤作用を学習する。
ドキソルビシン(化学薬理)の薬物動態モデルを用いて,ネット増殖率について検討した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.6071256756236916
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Quantitative systems pharmacology (QSP) is widely used to assess drug effects and toxicity before the drug goes to clinical trial. However, significant manual distillation of the literature is needed in order to construct a QSP model. Parameters may need to be fit, and simplifying assumptions of the model need to be made. In this work, we apply Universal Physics-Informed Neural Networks (UPINNs) to learn unknown components of various differential equations that model chemotherapy pharmacodynamics. We learn three commonly employed chemotherapeutic drug actions (log-kill, Norton-Simon, and E_max) from synthetic data. Then, we use the UPINN method to fit the parameters for several synthetic datasets simultaneously. Finally, we learn the net proliferation rate in a model of doxorubicin (a chemotherapeutic) pharmacodynamics. As these are only toy examples, we highlight the usefulness of UPINNs in learning unknown terms in pharmacodynamic and pharmacokinetic models.
- Abstract(参考訳): 定量的システム薬理学(QSP)は、薬物が臨床試験を受ける前に薬物効果と毒性を評価するために広く用いられている。
しかし,QSPモデルを構築するためには,重要な手作業による文献の蒸留が必要である。
パラメータは適合する必要があり、モデルの仮定を単純化する必要がある。
本研究では,化学療法薬理力学をモデル化する様々な微分方程式の未知の成分を学習するために,Universal Physics-Informed Neural Networks (UPINNs) を適用する。
我々は合成データから3つの一般的な薬剤作用(log-kill, Norton-Simon, E_max)を学習した。
次に、UPINN法を用いて、複数の合成データセットのパラメータを同時に適合させる。
最後にドキソルビシン(化学薬理)の薬物動態モデルを用いてネット増殖率を学習する。
これらは単なるおもちゃの例であり、医薬力学および薬物動態モデルにおける未知用語の学習におけるUPPNNの有用性を強調した。
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