論文の概要: Foundational GPT Model for MEG
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2404.09256v1
- Date: Sun, 14 Apr 2024 13:48:24 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-04-16 14:48:15.282261
- Title: Foundational GPT Model for MEG
- Title(参考訳): MEGの基本GPTモデル
- Authors: Richard Csaky, Mats W. J. van Es, Oiwi Parker Jones, Mark Woolrich,
- Abstract要約: 本研究では,脳信号の予測を用いて学習可能な2種類のディープラーニング基礎モデルを提案する。
まず、改良されたWavenetを検討し、次に、改良されたTransformer-based (GPT2)モデルを検討する。
我々は,これらのディープラーニングモデルの性能を,MEGデータに基づく標準的な線形自己回帰(AR)モデルと比較する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.524869467682149
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Deep learning techniques can be used to first training unsupervised models on large amounts of unlabelled data, before fine-tuning the models on specific tasks. This approach has seen massive success for various kinds of data, e.g. images, language, audio, and holds the promise of improving performance in various downstream tasks (e.g. encoding or decoding brain data). However, there has been limited progress taking this approach for modelling brain signals, such as Magneto-/electroencephalography (M/EEG). Here we propose two classes of deep learning foundational models that can be trained using forecasting of unlabelled MEG. First, we consider a modified Wavenet; and second, we consider a modified Transformer-based (GPT2) model. The modified GPT2 includes a novel application of tokenisation and embedding methods, allowing a model developed initially for the discrete domain of language to be applied to continuous multichannel time series data. We also extend the forecasting framework to include condition labels as inputs, enabling better modelling (encoding) of task data. We compare the performance of these deep learning models with standard linear autoregressive (AR) modelling on MEG data. This shows that GPT2-based models provide better modelling capabilities than Wavenet and linear AR models, by better reproducing the temporal, spatial and spectral characteristics of real data and evoked activity in task data. We show how the GPT2 model scales well to multiple subjects, while adapting its model to each subject through subject embedding. Finally, we show how such a model can be useful in downstream decoding tasks through data simulation. All code is available on GitHub (https://github.com/ricsinaruto/MEG-transfer-decoding).
- Abstract(参考訳): ディープラーニングのテクニックは、教師なしのモデルを大量の不正なデータで訓練した後、特定のタスクでモデルを微調整するために使用することができる。
このアプローチは、画像、言語、オーディオなど、さまざまな種類のデータに対して大きな成功を収め、さまざまな下流タスク(例えば、脳データのエンコーディングや復号化)のパフォーマンス向上を約束している。
しかし、磁気/電気脳波(M/EEG)のような脳波をモデル化するためのアプローチの進歩は限られている。
本稿では,未学習MEGの予測を用いて学習可能なディープラーニング基礎モデルの2つのクラスを提案する。
まず、改良されたWavenetを検討し、次に、改良されたTransformer-based (GPT2)モデルを検討する。
改良されたGPT2は、トークン化と埋め込みの新たな応用を含んでおり、言語独立領域のために最初に開発されたモデルを連続したマルチチャネル時系列データに適用することができる。
また、予測フレームワークを拡張して、条件ラベルを入力として含み、タスクデータのより優れたモデリング(エンコーディング)を可能にします。
我々は,これらのディープラーニングモデルの性能を,MEGデータに基づく標準的な線形自己回帰(AR)モデルと比較する。
これにより、実データとタスクデータにおける誘発活動の時間的・空間的・スペクトル的特性をよりよく再現することにより、GPT2ベースのモデルの方がWavenetや線形ARモデルよりも優れたモデリング能力が得られることを示す。
GPT2モデルが複数の対象に対してどのようにスケールするかを示すとともに,各対象に対して対象埋め込みによりモデルを適応させる。
最後に、データシミュレーションにより、下流の復号化タスクにおいて、そのようなモデルがどのように役立つかを示す。
すべてのコードはGitHubで入手できる(https://github.com/ricsinaruto/MEG-transfer-decoding)。
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