論文の概要: Self-supervised learning for classifying paranasal anomalies in the maxillary sinus
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2404.18599v1
- Date: Mon, 29 Apr 2024 11:14:11 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-04-30 13:57:37.657212
- Title: Self-supervised learning for classifying paranasal anomalies in the maxillary sinus
- Title(参考訳): 上顎洞における副鼻腔奇形分類のための自己指導型学習
- Authors: Debayan Bhattacharya, Finn Behrendt, Benjamin Tobias Becker, Lennart Maack, Dirk Beyersdorff, Elina Petersen, Marvin Petersen, Bastian Cheng, Dennis Eggert, Christian Betz, Anna Sophie Hoffmann, Alexander Schlaefer,
- Abstract要約: 自己教師付き学習は、ラベルのないデータから表現を学習するために使用することができる。
上顎洞の副鼻腔奇形を分類する下流タスクのために設計されたSSLメソッドはない。
提案手法では,教師なし異常検出フレームワークで訓練された3次元畳み込みオートエンコーダを用いる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 31.45131665942058
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Purpose: Paranasal anomalies, frequently identified in routine radiological screenings, exhibit diverse morphological characteristics. Due to the diversity of anomalies, supervised learning methods require large labelled dataset exhibiting diverse anomaly morphology. Self-supervised learning (SSL) can be used to learn representations from unlabelled data. However, there are no SSL methods designed for the downstream task of classifying paranasal anomalies in the maxillary sinus (MS). Methods: Our approach uses a 3D Convolutional Autoencoder (CAE) trained in an unsupervised anomaly detection (UAD) framework. Initially, we train the 3D CAE to reduce reconstruction errors when reconstructing normal maxillary sinus (MS) image. Then, this CAE is applied to an unlabelled dataset to generate coarse anomaly locations by creating residual MS images. Following this, a 3D Convolutional Neural Network (CNN) reconstructs these residual images, which forms our SSL task. Lastly, we fine-tune the encoder part of the 3D CNN on a labelled dataset of normal and anomalous MS images. Results: The proposed SSL technique exhibits superior performance compared to existing generic self-supervised methods, especially in scenarios with limited annotated data. When trained on just 10% of the annotated dataset, our method achieves an Area Under the Precision-Recall Curve (AUPRC) of 0.79 for the downstream classification task. This performance surpasses other methods, with BYOL attaining an AUPRC of 0.75, SimSiam at 0.74, SimCLR at 0.73 and Masked Autoencoding using SparK at 0.75. Conclusion: A self-supervised learning approach that inherently focuses on localizing paranasal anomalies proves to be advantageous, particularly when the subsequent task involves differentiating normal from anomalous maxillary sinuses. Access our code at https://github.com/mtec-tuhh/self-supervised-paranasal-anomaly
- Abstract(参考訳): 目的: 定期的な放射線検診でしばしば同定される副鼻腔奇形は, 様々な形態学的特徴を示す。
異常の多様性のため、教師付き学習法は多様な異常形態を示す大きなラベル付きデータセットを必要とする。
自己教師付き学習(SSL)は、不正なデータから表現を学習するために使用することができる。
しかし、上顎洞(MS)の副鼻腔異常を分類する下流タスクのために設計されたSSLメソッドは存在しない。
方法: 本手法では, 教師なし異常検出(UAD)フレームワークで訓練された3次元畳み込みオートエンコーダ(CAE)を用いる。
当初,正常上顎洞(MS)画像の再構成時に3D CAEをトレーニングし,再建誤差を低減する。
そして、このCAEを非ラベルデータセットに適用し、残差MS画像を生成して粗い異常位置を生成する。
その後、3D畳み込みニューラルネットワーク(CNN)が残像を再構成し、SSLタスクを形成します。
最後に、3D CNNのエンコーダ部分を正規および異常なMS画像のラベル付きデータセットで微調整する。
結果:提案手法は,特に注釈付きデータに制限のあるシナリオにおいて,既存の汎用的な自己管理手法と比較して優れた性能を示す。
注釈付きデータセットの10%だけをトレーニングすると、下流分類タスクに対して精度-リコール曲線(AUPRC)0.79のエリアを達成できる。
この性能は、AUPRC 0.75、SimSiam 0.74、SimCLR 0.73、Masked Autoencoding 0.75など、他の手法を上回る。
結論: 副鼻腔異常の局所化に本質的に焦点を絞った自己教師型学習アプローチは、特にその後の課題が正常と異常な上顎洞罪の区別を伴う場合、有利であることが証明される。
https://github.com/mtec-tuhh/self-supervised-paranasal-anomaly
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