論文の概要: Diffeomorphic Transformer-based Abdomen MRI-CT Deformable Image Registration
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2405.02692v1
- Date: Sat, 4 May 2024 15:04:06 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-05-07 18:49:54.457526
- Title: Diffeomorphic Transformer-based Abdomen MRI-CT Deformable Image Registration
- Title(参考訳): Diffomorphic Transformer-based Abdomen MRI-CT deformable Image Registration
- Authors: Yang Lei, Luke A. Matkovic, Justin Roper, Tonghe Wang, Jun Zhou, Beth Ghavidel, Mark McDonald, Pretesh Patel, Xiaofeng Yang,
- Abstract要約: 本稿では,腹部MRI-CT画像を直接登録するための変形ベクトル場(DVF)を推定できるディープラーニングフレームワークの構築を目的とする。
運動追跡における優れた性能を示すSwin変換器を畳み込みニューラルネットワーク(CNN)に統合したモデル
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.204992327758393
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: This paper aims to create a deep learning framework that can estimate the deformation vector field (DVF) for directly registering abdominal MRI-CT images. The proposed method assumed a diffeomorphic deformation. By using topology-preserved deformation features extracted from the probabilistic diffeomorphic registration model, abdominal motion can be accurately obtained and utilized for DVF estimation. The model integrated Swin transformers, which have demonstrated superior performance in motion tracking, into the convolutional neural network (CNN) for deformation feature extraction. The model was optimized using a cross-modality image similarity loss and a surface matching loss. To compute the image loss, a modality-independent neighborhood descriptor (MIND) was used between the deformed MRI and CT images. The surface matching loss was determined by measuring the distance between the warped coordinates of the surfaces of contoured structures on the MRI and CT images. The deformed MRI image was assessed against the CT image using the target registration error (TRE), Dice similarity coefficient (DSC), and mean surface distance (MSD) between the deformed contours of the MRI image and manual contours of the CT image. When compared to only rigid registration, DIR with the proposed method resulted in an increase of the mean DSC values of the liver and portal vein from 0.850 and 0.628 to 0.903 and 0.763, a decrease of the mean MSD of the liver from 7.216 mm to 3.232 mm, and a decrease of the TRE from 26.238 mm to 8.492 mm. The proposed deformable image registration method based on a diffeomorphic transformer provides an effective and efficient way to generate an accurate DVF from an MRI-CT image pair of the abdomen. It could be utilized in the current treatment planning workflow for liver radiotherapy.
- Abstract(参考訳): 本稿では,腹部MRI-CT画像を直接登録するための変形ベクトル場(DVF)を推定できるディープラーニングフレームワークの構築を目的とする。
提案手法は微分同相変形を仮定する。
確率微分同相登録モデルから抽出した位相保存変形特徴を用いて,DVF推定に腹部の動きを正確に求めることができる。
モデルでは,変形特徴抽出のための畳み込みニューラルネットワーク(CNN)に,運動追跡の優れた性能を示すスウィン変換器を組み込んだ。
モデルでは,画像類似性損失と表面整合損失を用いて最適化した。
画像損失を計算するために、変形したMRI画像とCT画像の間にモダリティ非依存の近傍記述子(MIND)を用いた。
MRIおよびCT画像上での凹凸構造の表面の歪んだ座標間の距離を計測することにより表面整合損失を判定した。
対象登録誤差(TRE),Dice類似度係数(DSC),およびCT画像の変形輪郭と手動輪郭間の平均表面距離(MSD)を用いてCT画像に対して変形MRI画像の評価を行った。
硬式登録のみと比較してDIRは肝門脈のDSC値が0.850,0.628,0.903,0.763,肝臓のMSDが7.216mmから3.232mmに減少し,TREが26.238mmから8.492mmに減少した。
微分同相変換器を用いた変形可能な画像登録法は,腹部MRI-CT画像対から正確なDVFを生成する有効な方法を提供する。
これは、現在の肝放射線治療のための治療計画ワークフローで利用することができる。
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