論文の概要: Are Protein Language Models Compute Optimal?

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2406.07249v1
• Date: Tue, 11 Jun 2024 13:32:11 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2024-06-12 15:54:07.303960
• Title: Are Protein Language Models Compute Optimal?
• Title（参考訳）: タンパク質言語モデルは最適か?
• Authors: Yaiza Serrano, Álvaro Ciudad, Alexis Molina,
• Abstract要約: 固定計算予算におけるモデルパラメータとトレーニングトークンの最適比について検討する。 本研究により, pLM サイズは計算予算とともにサブ線形にスケールし, モデルサイズが大きくなるにつれて性能が低下することが示された。 この研究は、より計算効率の良いPLMへの道を開き、そのトレーニングと計算生物学の実践的応用を民主化している。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 0.0
• License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
• Abstract: While protein language models (pLMs) have transformed biological research, the scaling laws governing their improvement remain underexplored. By adapting methodologies from NLP scaling laws, we investigated the optimal ratio between model parameters and training tokens within a fixed compute budget. Our study reveals that pLM sizes scale sublinearly with compute budget, showing diminishing returns in performance as model size increases, and we identify a performance plateau in training loss comparable to the one found in relevant works in the field. Our findings suggest that widely-used pLMs might not be compute-optimal, indicating that larger models could achieve convergence more efficiently. Training a 35M model on a reduced token set, we attained perplexity results comparable to larger models like ESM-2 (15B) and xTrimoPGLM (100B) with a single dataset pass. This work paves the way towards more compute-efficient pLMs, democratizing their training and practical application in computational biology.
• Abstract（参考訳）: タンパク質言語モデル (pLMs) は生物学的研究に変化をもたらしたが、その改善を規定するスケーリング法則は未解明のままである。 NLPスケーリング法則からの方法論の適用により,固定された計算予算内でのモデルパラメータとトレーニングトークンの最適比を検討した。 本研究は,pLMサイズが計算予算に比例してスケールし,モデルサイズが大きくなるにつれて性能が低下することを示した。 以上の結果から,広く使用されているpLMは計算最適ではない可能性が示唆され,より大きなモデルの方がより効率的に収束できる可能性が示唆された。 トークンセットの縮小で35Mモデルをトレーニングし,ESM-2 (15B) や xTrimoPGLM (100B) のような大規模モデルに匹敵する複雑な結果を得た。 この研究は、より計算効率の良いPLMへの道を開き、そのトレーニングと計算生物学の実践的応用を民主化している。

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