論文の概要: Inverse Probability of Treatment Weighting with Deep Sequence Models Enables Accurate treatment effect Estimation from Electronic Health Records
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2406.08851v1
- Date: Thu, 13 Jun 2024 06:29:16 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-06-14 19:03:54.720820
- Title: Inverse Probability of Treatment Weighting with Deep Sequence Models Enables Accurate treatment effect Estimation from Electronic Health Records
- Title(参考訳): 電子カルテからの精度の高い治療効果推定を可能にする深部列モデルによる治療重量の逆確率
- Authors: Junghwan Lee, Simin Ma, Nicoleta Serban, Shihao Yang,
- Abstract要約: 治療重み付けの逆確率 (IPTW) は広く用いられている確率スコア法である。
我々は,IMTWを用いて,クレームレコードを用いた時間依存コンバウンディングの存在下での処理効果を推定することを提案する。
ディープシークエンスモデルは、様々な下流タスクのためのEHRのモデリングにおいて優れた性能を示している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.1824562114990471
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Observational data have been actively used to estimate treatment effect, driven by the growing availability of electronic health records (EHRs). However, EHRs typically consist of longitudinal records, often introducing time-dependent confoundings that hinder the unbiased estimation of treatment effect. Inverse probability of treatment weighting (IPTW) is a widely used propensity score method since it provides unbiased treatment effect estimation and its derivation is straightforward. In this study, we aim to utilize IPTW to estimate treatment effect in the presence of time-dependent confounding using claims records. Previous studies have utilized propensity score methods with features derived from claims records through feature processing, which generally requires domain knowledge and additional resources to extract information to accurately estimate propensity scores. Deep sequence models, particularly recurrent neural networks and self-attention-based architectures, have demonstrated good performance in modeling EHRs for various downstream tasks. We propose that these deep sequence models can provide accurate IPTW estimation of treatment effect by directly estimating the propensity scores from claims records without the need for feature processing. We empirically demonstrate this by conducting comprehensive evaluations using synthetic and semi-synthetic datasets.
- Abstract(参考訳): 電子健康記録(EHR)の増大に伴う治療効果の推計には,観察データの利用が盛んに行われている。
しかしながら、EHRは通常、経年記録から成り、しばしば時間依存のコンファウンディングを導入し、治療効果の偏りのない推定を妨げている。
処理重み付けの逆確率 (IPTW) は、不偏処理効果の推定を提供し、その導出が容易であるため、広く用いられている確率スコア法である。
本研究では,IPTWを用いて,クレーム記録を用いた時間依存的コンファウンディングの存在下での処理効果を推定することを目的とする。
従来の研究では, 情報抽出にドメイン知識と追加資源を必要とする特徴処理を通じて, クレーム記録から派生した特徴を持つ確率スコア法を用いて, 正確さスコアを推定している。
ディープシーケンスモデル、特にリカレントニューラルネットワークと自己アテンションに基づくアーキテクチャは、さまざまな下流タスクのためのEHRをモデル化する上で、優れたパフォーマンスを示している。
我々は,これらの深部配列モデルを用いて,特徴処理を必要とせずに,クレームレコードからの適合度スコアを直接推定することにより,処理効果の精度の高い IPTW 推定が可能であることを提案する。
合成および半合成データセットを用いて包括的評価を行うことによりこれを実証的に実証する。
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