Fugu-MT 論文翻訳(概要): Leveraging Pre-trained Models for FF-to-FFPE Histopathological Image Translation

論文の概要: Leveraging Pre-trained Models for FF-to-FFPE Histopathological Image Translation

arxiv url: http://arxiv.org/abs/2406.18054v1
Date: Wed, 26 Jun 2024 04:12:34 GMT
ステータス: 処理完了
システム内更新日: 2024-06-27 14:38:19.388948
Title: Leveraging Pre-trained Models for FF-to-FFPE Histopathological Image Translation
Title（参考訳）: FF-to-FFPE画像翻訳のための事前学習モデルの活用
Authors: Qilai Zhang, Jiawen Li, Peiran Liao, Jiali Hu, Tian Guan, Anjia Han, Yonghong He,
Abstract要約: Diffusion-FFPE は Formalin-Fixed Paraffin-Embedded (FFPE) 画像を Fresh Frozen (FFPE) 画像に変換する方法である。生成元として一段階拡散モデルを用い、対向学習目的を用いてLoRAアダプタで微調整する。我々は,TCGA-NSCLCデータセット上でFF-to-FFPE翻訳実験を行い,他の手法と比較して性能が向上した。
参考スコア（独自算出の注目度）: 6.108290302640328
License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
Abstract: The two primary types of Hematoxylin and Eosin (H&E) slides in histopathology are Formalin-Fixed Paraffin-Embedded (FFPE) and Fresh Frozen (FF). FFPE slides offer high quality histopathological images but require a labor-intensive acquisition process. In contrast, FF slides can be prepared quickly, but the image quality is relatively poor. Our task is to translate FF images into FFPE style, thereby improving the image quality for diagnostic purposes. In this paper, we propose Diffusion-FFPE, a method for FF-to-FFPE histopathological image translation using a pre-trained diffusion model. Specifically, we employ a one-step diffusion model as the generator and fine-tune it with LoRA adapters using adversarial learning objectives. To ensure that the model effectively captures both global structural information and local details, we propose a multi-scale feature fusion (MFF) module. This module utilizes two VAE encoders to extract features of varying image sizes and performs feature fusion before feeding them into the UNet. Furthermore, we utilize a pre-trained vision-language model for histopathology as the backbone for the discriminator to further improve performance We conducted FF-to-FFPE translation experiments on the TCGA-NSCLC datasets, and our method achieved better performance compared to other methods. The code and models are released at https://github.com/QilaiZhang/Diffusion-FFPE.
Abstract（参考訳）: 病理組織学におけるヘマトキシリンとエオシン(H&E)スライドの2つの主要なタイプは、ホルマリン固定パラフィン埋め込み(FFPE)とフレッシュフロゼン(FF)である。 FFPEスライドは高品質な病理像を提供するが、労働集約的な取得プロセスを必要とする。対照的に、FFスライドは迅速に作成できるが、画質は比較的低い。本研究の目的は,FFPE画像からFFPE画像へ変換することで,診断目的の画像品質を向上させることである。本稿では,事前学習した拡散モデルを用いたFF-to-FFPE画像変換法であるDiffusion-FFPEを提案する。具体的には,1ステップの拡散モデルをジェネレータとして使用し,対角学習目的を用いてLoRAアダプタで微調整する。モデルがグローバルな構造情報と局所的な詳細の両方を効果的に捉えるために,マルチスケール機能融合(MFF)モジュールを提案する。このモジュールは2つのVAEエンコーダを使用して、様々な画像サイズの特徴を抽出し、UNetに入力する前に特徴フュージョンを実行する。さらに, 本手法は, TCGA-NSCLCデータセット上でFF-to-FFPE翻訳実験を行い, 他の手法と比較して優れた性能を示した。コードとモデルはhttps://github.com/QilaiZhang/Diffusion-FFPEで公開されている。

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