論文の概要: Multiple Kronecker RLS fusion-based link propagation for drug-side effect prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2407.00105v1
- Date: Thu, 27 Jun 2024 08:50:25 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-07-04 06:30:11.873657
- Title: Multiple Kronecker RLS fusion-based link propagation for drug-side effect prediction
- Title(参考訳): 薬物副作用予測のための複数Kronecker RLS融合型リンク伝播
- Authors: Yuqing Qian, Ziyu Zheng, Prayag Tiwari, Yijie Ding, Quan Zou,
- Abstract要約: 薬物側の効果予測はリンク予測の問題であり、関連するデータは様々な観点から説明することができる。
このようなデータを処理するために、MKronRLSF-LP(Multiple Kronecker RLS fusion-based link propagation)と呼ばれるマルチビュー手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.168105118038268
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Drug-side effect prediction has become an essential area of research in the field of pharmacology. As the use of medications continues to rise, so does the importance of understanding and mitigating the potential risks associated with them. At present, researchers have turned to data-driven methods to predict drug-side effects. Drug-side effect prediction is a link prediction problem, and the related data can be described from various perspectives. To process these kinds of data, a multi-view method, called Multiple Kronecker RLS fusion-based link propagation (MKronRLSF-LP), is proposed. MKronRLSF-LP extends the Kron-RLS by finding the consensus partitions and multiple graph Laplacian constraints in the multi-view setting. Both of these multi-view settings contribute to a higher quality result. Extensive experiments have been conducted on drug-side effect datasets, and our empirical results provide evidence that our approach is effective and robust.
- Abstract(参考訳): 薬物副作用の予測は薬理学の分野で重要な研究領域となっている。
薬物の使用が増加し続ければ、それらに関連する潜在的なリスクを理解し緩和することの重要性も増す。
現在、研究者は薬物副作用を予測するデータ駆動方式に転換している。
薬物側の効果予測はリンク予測の問題であり、関連するデータは様々な観点から説明することができる。
このようなデータを処理するために、MKronRLSF-LP(Multiple Kronecker RLS fusion-based link propagation)と呼ばれるマルチビュー手法を提案する。
MKronRLSF-LPは、マルチビュー設定においてコンセンサスパーティションと複数のグラフラプラシアン制約を見つけることで、Kron-RLSを拡張する。
これらのマルチビュー設定はどちらも、より高品質な結果に寄与します。
薬物副作用データセットに関する大規模な実験が実施されており、我々の実験結果から、我々のアプローチが効果的で堅牢であることを示す証拠が得られている。
関連論文リスト
- XAI for In-hospital Mortality Prediction via Multimodal ICU Data [57.73357047856416]
マルチモーダルICUデータを用いて病院内死亡率を予測するための,効率的で説明可能なAIソリューションを提案する。
我々は,臨床データから異種入力を受信し,意思決定を行うマルチモーダル・ラーニングを我々のフレームワークに導入する。
我々の枠組みは、医療研究において重要な要素の発見を容易にする他の臨床課題に容易に移行することができる。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-12-29T14:28:04Z) - Multiscale Topology in Interactomic Network: From Transcriptome to
Antiaddiction Drug Repurposing [0.3683202928838613]
米国における薬物依存の激化は、革新的な治療戦略の緊急の必要性を浮き彫りにしている。
本研究は,オピオイドおよびコカイン依存症治療の薬物再服用候補を探索するための,革新的で厳格な戦略に着手した。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-12-03T04:01:38Z) - The Blessings of Multiple Treatments and Outcomes in Treatment Effect
Estimation [53.81860494566915]
既存の研究では、プロキシ変数や複数の処理を利用してバイアスを補正している。
多くの実世界のシナリオでは、複数の結果に対する影響を研究することにより大きな関心がある。
この設定に関わる複数の結果の並列研究は、因果同定において互いに助け合うことが示されている。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-09-29T14:33:48Z) - Drug Synergistic Combinations Predictions via Large-Scale Pre-Training
and Graph Structure Learning [82.93806087715507]
薬物併用療法は、より有効で安全性の低い疾患治療のための確立された戦略である。
ディープラーニングモデルは、シナジスティックな組み合わせを発見する効率的な方法として登場した。
我々のフレームワークは、他のディープラーニングベースの手法と比較して最先端の結果を達成する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-01-14T15:07:43Z) - Unsupervised EHR-based Phenotyping via Matrix and Tensor Decompositions [0.6875312133832078]
本稿では,低ランク近似に基づく計算表現法について概観する。
近年,様々な制約を組み込んだ低ランクデータ近似手法が開発され,解釈可能性の向上が図られている。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-09-01T09:47:27Z) - SSM-DTA: Breaking the Barriers of Data Scarcity in Drug-Target Affinity
Prediction [127.43571146741984]
薬物標的親和性(DTA)は、早期の薬物発見において極めて重要である。
湿式実験は依然として最も信頼性の高い方法であるが、時間と資源が集中している。
既存の手法は主に、データ不足の問題に適切に対処することなく、利用可能なDTAデータに基づく技術開発に重点を置いている。
SSM-DTAフレームワークについて述べる。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-06-20T14:53:25Z) - Modular multi-source prediction of drug side-effects with DruGNN [3.229607826010618]
薬物副作用(DSE)は公衆衛生、医療システムコスト、薬物発見プロセスに高い影響を与える。
それらの発生を予測するためには、異種源からのデータを統合する必要がある。
この研究において、そのような異種データはグラフデータセットに統合され、異なるエンティティ間の関係情報を表現的に表現する。
グラフニューラルネットワーク(GNN)は、データセット上のDSEを非常に有望な結果で予測するために利用される。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-02-15T09:41:05Z) - Multiple Similarity Drug-Target Interaction Prediction with Random Walks
and Matrix Factorization [16.41618129467975]
我々は、異なるレイヤが薬物と標的の異なる類似度メトリクスに対応する、多層ネットワークの視点を捉えている。
複数のビューでキャプチャされたトポロジ情報を完全に活用するために,DTI予測のための最適化フレームワーク MDMF を開発した。
このフレームワークは、すべての超分子層にまたがる高次近接を維持するだけでなく、内部積との相互作用を近似する薬物や標的のベクトル表現を学習する。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-01-24T08:02:05Z) - SurvITE: Learning Heterogeneous Treatment Effects from Time-to-Event
Data [83.50281440043241]
時系列データから不均一な処理効果を推定する問題について検討する。
本稿では,バランス表現に基づく治療特異的ハザード推定のための新しいディープラーニング手法を提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-10-26T20:13:17Z) - Enabling Counterfactual Survival Analysis with Balanced Representations [64.17342727357618]
生存データは様々な医学的応用、すなわち薬物開発、リスクプロファイリング、臨床試験で頻繁に見られる。
本稿では,生存結果に適用可能な対実的推論のための理論的基盤を持つ統一的枠組みを提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-06-14T01:15:00Z) - Reinforcement learning and Bayesian data assimilation for model-informed
precision dosing in oncology [0.0]
現在の戦略はモデルインフォームドドッキングテーブルで構成されている。
ベイジアンデータ同化と/または強化学習を併用したMIPDのための新しい3つのアプローチを提案する。
これらのアプローチは、致命的グレード4と治療下グレード0のニュートロピーの発生を著しく減少させる可能性がある。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-06-01T16:38:27Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。