論文の概要: PathGen-1.6M: 1.6 Million Pathology Image-text Pairs Generation through Multi-agent Collaboration
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2407.00203v1
- Date: Fri, 28 Jun 2024 19:18:09 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-07-04 06:00:32.391031
- Title: PathGen-1.6M: 1.6 Million Pathology Image-text Pairs Generation through Multi-agent Collaboration
- Title(参考訳): PathGen-1.6M: マルチエージェントコラボレーションによる1.6万の病理画像テキストペア生成
- Authors: Yuxuan Sun, Yunlong Zhang, Yixuan Si, Chenglu Zhu, Zhongyi Shui, Kai Zhang, Jingxiong Li, Xingheng Lyu, Tao Lin, Lin Yang,
- Abstract要約: CLIPのような視覚言語モデル(VLM)は病理学に大きな注目を集めている。
病理学をトレーニングするための現在の取り組みは、PubMed、YouTube、Twitterなどのプラットフォームからの病理画像テキストペアに依存している。
TCGAのような大規模WSIデータセットを利用して、多数の高品質な画像パッチを抽出する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 14.979275480422213
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Vision Language Models (VLMs) like CLIP have attracted substantial attention in pathology, serving as backbones for applications such as zero-shot image classification and Whole Slide Image (WSI) analysis. Additionally, they can function as vision encoders when combined with large language models (LLMs) to support broader capabilities. Current efforts to train pathology VLMs rely on pathology image-text pairs from platforms like PubMed, YouTube, and Twitter, which provide limited, unscalable data with generally suboptimal image quality. In this work, we leverage large-scale WSI datasets like TCGA to extract numerous high-quality image patches. We then train a large multimodal model to generate captions for these images, creating PathGen-1.6M, a dataset containing 1.6 million high-quality image-caption pairs. Our approach involves multiple agent models collaborating to extract representative WSI patches, generating and refining captions to obtain high-quality image-text pairs. Extensive experiments show that integrating these generated pairs with existing datasets to train a pathology-specific CLIP model, PathGen-CLIP, significantly enhances its ability to analyze pathological images, with substantial improvements across nine pathology-related zero-shot image classification tasks and three whole-slide image tasks. Furthermore, we construct 200K instruction-tuning data based on PathGen-1.6M and integrate PathGen-CLIP with the Vicuna LLM to create more powerful multimodal models through instruction tuning. Overall, we provide a scalable pathway for high-quality data generation in pathology, paving the way for next-generation general pathology models.
- Abstract(参考訳): CLIPのような視覚言語モデル(VLM)は、ゼロショット画像分類や全スライド画像(WSI)解析などのアプリケーションのためのバックボーンとして、病理学において大きな注目を集めている。
さらに、より大きな機能をサポートするために、大きな言語モデル(LLM)と組み合わせることで、ビジョンエンコーダとして機能する。
VLMをトレーニングするための現在の取り組みは、PubMed、YouTube、Twitterなどのプラットフォームからの病理画像テキストペアに依存している。
本稿では,TCGAのような大規模WSIデータセットを活用し,高品質な画像パッチを抽出する。
次に、これらの画像のキャプションを生成するために、大規模なマルチモーダルモデルをトレーニングし、1.6万の高品質画像キャプチャーペアを含むデータセットであるPathGen-1.6Mを作成します。
提案手法では,複数のエージェントモデルを用いてWSIパッチを抽出し,キャプションの生成と精錬を行い,高品質な画像テキストペアを得る。
大規模な実験によると、これらの生成されたペアを既存のデータセットと統合して、病理固有のCLIPモデルであるPathGen-CLIPをトレーニングすることで、病理画像を分析する能力が大幅に向上し、9つの病理関連ゼロショット画像分類タスクと3つの全スライダー画像タスクに大幅に改善されている。
さらに,PathGen-1.6Mに基づく200K命令チューニングデータを構築し,PathGen-CLIPとVicuna LLMを統合し,命令チューニングによるより強力なマルチモーダルモデルを作成する。
全体として、我々は、病理学における高品質なデータ生成のためのスケーラブルな経路を提供し、次世代の一般的な病理学モデルへの道を開いた。
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